Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

Predictions only

Length 2,201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNCP24821 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNCP24821 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TNCP24821 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNCP24821 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNCP24821 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNCP24821 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNCP24821 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNCP24821 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNCP24821 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNCP24821 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNCP24821 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNCP24821 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNCP24821 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNCP24821 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNCP24821 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNCP24821 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TNCP24821 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNCP24821 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNCP24821 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNCP24821 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNCP24821 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNCP24821 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNCP24821 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNCP24821 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNCP24821 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNCP24821 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNCP24821 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNCP24821 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNCP24821 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNCP24821 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNCP24821 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNCP24821 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNCP24821 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNCP24821 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNCP24821 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNCP24821 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNCP24821 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNCP24821 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNCP24821 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNCP24821 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNCP24821 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNCP24821 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNCP24821 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNCP24821 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNCP24821 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNCP24821 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNCP24821 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNCP24821 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNCP24821 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNCP24821 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNCP24821 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNCP24821 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNCP24821 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNCP24821 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNCP24821 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNCP24821 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNCP24821 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNCP24821 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNCP24821 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNCP24821 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNCP24821 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNCP24821 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNCP24821 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNCP24821 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNCP24821 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNCP24821 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNCP24821 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNCP24821 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNCP24821 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNCP24821 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNCP24821 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNCP24821 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNCP24821 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNCP24821 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNCP24821 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNCP24821 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNCP24821 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNCP24821 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNCP24821 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNCP24821 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNCP24821 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNCP24821 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNCP24821 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNCP24821 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TNCP24821 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNCP24821 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNCP24821 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNCP24821 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNCP24821 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TNCP24821 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNCP24821 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNCP24821 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNCP24821 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNCP24821 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNCP24821 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNCP24821 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNCP24821 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNCP24821 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNCP24821 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms