Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNB3P16520 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNB3P16520 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNB3P16520 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNB3P16520 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GNB3P16520 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNB3P16520 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GNB3P16520 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNB3P16520 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNB3P16520 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNB3P16520 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNB3P16520 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNB3P16520 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNB3P16520 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNB3P16520 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNB3P16520 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNB3P16520 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GNB3P16520 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNB3P16520 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNB3P16520 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GNB3P16520 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GNB3P16520 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GNB3P16520 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GNB3P16520 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GNB3P16520 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GNB3P16520 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GNB3P16520 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GNB3P16520 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GNB3P16520 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GNB3P16520 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNB3P16520 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNB3P16520 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNB3P16520 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNB3P16520 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNB3P16520 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNB3P16520 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNB3P16520 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNB3P16520 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNB3P16520 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNB3P16520 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GNB3P16520 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNB3P16520 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GNB3P16520 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GNB3P16520 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GNB3P16520 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GNB3P16520 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GNB3P16520 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GNB3P16520 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNB3P16520 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNB3P16520 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNB3P16520 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNB3P16520 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNB3P16520 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNB3P16520 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNB3P16520 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GNB3P16520 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GNB3P16520 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GNB3P16520 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GNB3P16520 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GNB3P16520 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GNB3P16520 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNB3P16520 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNB3P16520 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNB3P16520 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNB3P16520 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GNB3P16520 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GNB3P16520 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GNB3P16520 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GNB3P16520 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNB3P16520 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNB3P16520 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNB3P16520 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GNB3P16520 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNB3P16520 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNB3P16520 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNB3P16520 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNB3P16520 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNB3P16520 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNB3P16520 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNB3P16520 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GNB3P16520 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GNB3P16520 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GNB3P16520 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GNB3P16520 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GNB3P16520 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GNB3P16520 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GNB3P16520 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNB3P16520 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNB3P16520 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNB3P16520 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNB3P16520 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GNB3P16520 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNB3P16520 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNB3P16520 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNB3P16520 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNB3P16520 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNB3P16520 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNB3P16520 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNB3P16520 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNB3P16520 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms