Protein–RNA interactions for Protein: P0C672

TSPAN19, Putative tetraspanin-19, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN19P0C672 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN19P0C672 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN19P0C672 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN19P0C672 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSPAN19P0C672 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN19P0C672 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN19P0C672 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN19P0C672 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN19P0C672 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN19P0C672 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSPAN19P0C672 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSPAN19P0C672 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSPAN19P0C672 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSPAN19P0C672 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSPAN19P0C672 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSPAN19P0C672 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSPAN19P0C672 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSPAN19P0C672 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSPAN19P0C672 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSPAN19P0C672 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSPAN19P0C672 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSPAN19P0C672 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSPAN19P0C672 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN19P0C672 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN19P0C672 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN19P0C672 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSPAN19P0C672 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPAN19P0C672 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN19P0C672 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN19P0C672 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN19P0C672 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN19P0C672 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPAN19P0C672 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN19P0C672 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN19P0C672 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN19P0C672 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN19P0C672 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPAN19P0C672 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN19P0C672 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPAN19P0C672 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN19P0C672 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSPAN19P0C672 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN19P0C672 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN19P0C672 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN19P0C672 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN19P0C672 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN19P0C672 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN19P0C672 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN19P0C672 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN19P0C672 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN19P0C672 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN19P0C672 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN19P0C672 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN19P0C672 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN19P0C672 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN19P0C672 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN19P0C672 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN19P0C672 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN19P0C672 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN19P0C672 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN19P0C672 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN19P0C672 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN19P0C672 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN19P0C672 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN19P0C672 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN19P0C672 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN19P0C672 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSPAN19P0C672 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSPAN19P0C672 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSPAN19P0C672 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSPAN19P0C672 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN19P0C672 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN19P0C672 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN19P0C672 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN19P0C672 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN19P0C672 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN19P0C672 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN19P0C672 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN19P0C672 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSPAN19P0C672 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN19P0C672 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN19P0C672 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN19P0C672 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN19P0C672 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN19P0C672 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN19P0C672 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN19P0C672 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN19P0C672 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN19P0C672 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN19P0C672 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN19P0C672 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN19P0C672 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN19P0C672 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN19P0C672 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN19P0C672 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN19P0C672 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN19P0C672 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN19P0C672 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN19P0C672 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN19P0C672 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms