Protein–RNA interactions for Protein: O95259

KCNH1, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 1, humanhuman

Predictions only

Length 989 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH1O95259 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNH1O95259 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNH1O95259 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNH1O95259 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNH1O95259 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNH1O95259 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNH1O95259 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNH1O95259 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNH1O95259 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNH1O95259 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNH1O95259 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNH1O95259 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNH1O95259 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNH1O95259 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNH1O95259 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNH1O95259 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNH1O95259 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNH1O95259 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNH1O95259 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNH1O95259 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNH1O95259 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNH1O95259 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNH1O95259 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNH1O95259 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNH1O95259 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNH1O95259 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNH1O95259 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNH1O95259 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNH1O95259 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNH1O95259 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNH1O95259 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNH1O95259 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNH1O95259 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNH1O95259 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNH1O95259 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNH1O95259 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNH1O95259 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNH1O95259 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNH1O95259 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNH1O95259 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNH1O95259 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNH1O95259 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNH1O95259 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNH1O95259 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNH1O95259 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNH1O95259 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNH1O95259 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNH1O95259 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNH1O95259 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNH1O95259 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNH1O95259 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNH1O95259 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNH1O95259 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNH1O95259 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNH1O95259 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNH1O95259 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNH1O95259 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNH1O95259 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNH1O95259 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNH1O95259 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNH1O95259 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNH1O95259 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNH1O95259 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNH1O95259 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNH1O95259 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNH1O95259 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNH1O95259 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNH1O95259 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNH1O95259 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNH1O95259 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNH1O95259 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNH1O95259 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNH1O95259 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNH1O95259 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNH1O95259 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNH1O95259 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNH1O95259 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNH1O95259 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNH1O95259 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNH1O95259 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNH1O95259 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNH1O95259 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNH1O95259 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNH1O95259 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNH1O95259 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNH1O95259 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNH1O95259 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNH1O95259 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNH1O95259 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNH1O95259 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNH1O95259 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNH1O95259 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNH1O95259 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNH1O95259 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNH1O95259 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNH1O95259 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNH1O95259 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNH1O95259 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNH1O95259 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNH1O95259 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms