Protein–RNA interactions for Protein: O60566

BUB1B, Mitotic checkpoint serine/threonine-protein kinase BUB1 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUB1BO60566 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BUB1BO60566 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BUB1BO60566 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BUB1BO60566 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BUB1BO60566 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BUB1BO60566 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BUB1BO60566 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BUB1BO60566 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BUB1BO60566 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
BUB1BO60566 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BUB1BO60566 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BUB1BO60566 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BUB1BO60566 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BUB1BO60566 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BUB1BO60566 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BUB1BO60566 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BUB1BO60566 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BUB1BO60566 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BUB1BO60566 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BUB1BO60566 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BUB1BO60566 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BUB1BO60566 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BUB1BO60566 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BUB1BO60566 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BUB1BO60566 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BUB1BO60566 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BUB1BO60566 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BUB1BO60566 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BUB1BO60566 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BUB1BO60566 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BUB1BO60566 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BUB1BO60566 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BUB1BO60566 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BUB1BO60566 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BUB1BO60566 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BUB1BO60566 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BUB1BO60566 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BUB1BO60566 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BUB1BO60566 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BUB1BO60566 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
BUB1BO60566 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BUB1BO60566 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BUB1BO60566 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BUB1BO60566 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BUB1BO60566 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BUB1BO60566 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BUB1BO60566 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BUB1BO60566 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BUB1BO60566 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BUB1BO60566 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BUB1BO60566 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BUB1BO60566 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BUB1BO60566 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BUB1BO60566 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
BUB1BO60566 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BUB1BO60566 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BUB1BO60566 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BUB1BO60566 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BUB1BO60566 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BUB1BO60566 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BUB1BO60566 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BUB1BO60566 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BUB1BO60566 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BUB1BO60566 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BUB1BO60566 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BUB1BO60566 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BUB1BO60566 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BUB1BO60566 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BUB1BO60566 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BUB1BO60566 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BUB1BO60566 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BUB1BO60566 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BUB1BO60566 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BUB1BO60566 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BUB1BO60566 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BUB1BO60566 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BUB1BO60566 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BUB1BO60566 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BUB1BO60566 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
BUB1BO60566 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BUB1BO60566 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
BUB1BO60566 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BUB1BO60566 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BUB1BO60566 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BUB1BO60566 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BUB1BO60566 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BUB1BO60566 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BUB1BO60566 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BUB1BO60566 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BUB1BO60566 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BUB1BO60566 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BUB1BO60566 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BUB1BO60566 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BUB1BO60566 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BUB1BO60566 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BUB1BO60566 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BUB1BO60566 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BUB1BO60566 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BUB1BO60566 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BUB1BO60566 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms