Protein–RNA interactions for Protein: O60499

STX10, Syntaxin-10, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX10O60499 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
STX10O60499 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
STX10O60499 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
STX10O60499 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
STX10O60499 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
STX10O60499 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
STX10O60499 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
STX10O60499 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
STX10O60499 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
STX10O60499 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
STX10O60499 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
STX10O60499 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
STX10O60499 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
STX10O60499 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
STX10O60499 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
STX10O60499 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
STX10O60499 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
STX10O60499 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
STX10O60499 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
STX10O60499 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
STX10O60499 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
STX10O60499 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
STX10O60499 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
STX10O60499 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
STX10O60499 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
STX10O60499 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
STX10O60499 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
STX10O60499 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
STX10O60499 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
STX10O60499 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
STX10O60499 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
STX10O60499 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
STX10O60499 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
STX10O60499 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
STX10O60499 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
STX10O60499 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
STX10O60499 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
STX10O60499 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
STX10O60499 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
STX10O60499 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
STX10O60499 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
STX10O60499 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
STX10O60499 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
STX10O60499 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
STX10O60499 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
STX10O60499 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
STX10O60499 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
STX10O60499 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
STX10O60499 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
STX10O60499 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
STX10O60499 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
STX10O60499 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
STX10O60499 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
STX10O60499 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
STX10O60499 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
STX10O60499 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
STX10O60499 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
STX10O60499 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
STX10O60499 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
STX10O60499 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
STX10O60499 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
STX10O60499 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
STX10O60499 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
STX10O60499 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
STX10O60499 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
STX10O60499 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
STX10O60499 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
STX10O60499 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
STX10O60499 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
STX10O60499 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
STX10O60499 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
STX10O60499 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
STX10O60499 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
STX10O60499 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
STX10O60499 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
STX10O60499 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
STX10O60499 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
STX10O60499 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
STX10O60499 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
STX10O60499 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
STX10O60499 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
STX10O60499 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
STX10O60499 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
STX10O60499 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
STX10O60499 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
STX10O60499 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
STX10O60499 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
STX10O60499 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
STX10O60499 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
STX10O60499 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
STX10O60499 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
STX10O60499 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
STX10O60499 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
STX10O60499 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
STX10O60499 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
STX10O60499 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
STX10O60499 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
STX10O60499 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
STX10O60499 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
STX10O60499 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms