Protein–RNA interactions for Protein: F2Z333

FNDC10, Fibronectin type III domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC10F2Z333 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FNDC10F2Z333 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNDC10F2Z333 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNDC10F2Z333 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNDC10F2Z333 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FNDC10F2Z333 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FNDC10F2Z333 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FNDC10F2Z333 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FNDC10F2Z333 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FNDC10F2Z333 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FNDC10F2Z333 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FNDC10F2Z333 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FNDC10F2Z333 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNDC10F2Z333 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNDC10F2Z333 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNDC10F2Z333 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNDC10F2Z333 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FNDC10F2Z333 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FNDC10F2Z333 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FNDC10F2Z333 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FNDC10F2Z333 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FNDC10F2Z333 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FNDC10F2Z333 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FNDC10F2Z333 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FNDC10F2Z333 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FNDC10F2Z333 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FNDC10F2Z333 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FNDC10F2Z333 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FNDC10F2Z333 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FNDC10F2Z333 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FNDC10F2Z333 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FNDC10F2Z333 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FNDC10F2Z333 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FNDC10F2Z333 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FNDC10F2Z333 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNDC10F2Z333 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNDC10F2Z333 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNDC10F2Z333 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNDC10F2Z333 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNDC10F2Z333 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNDC10F2Z333 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNDC10F2Z333 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNDC10F2Z333 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNDC10F2Z333 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNDC10F2Z333 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNDC10F2Z333 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNDC10F2Z333 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNDC10F2Z333 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
FNDC10F2Z333 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNDC10F2Z333 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNDC10F2Z333 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNDC10F2Z333 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNDC10F2Z333 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FNDC10F2Z333 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FNDC10F2Z333 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNDC10F2Z333 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNDC10F2Z333 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNDC10F2Z333 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNDC10F2Z333 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNDC10F2Z333 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNDC10F2Z333 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNDC10F2Z333 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNDC10F2Z333 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FNDC10F2Z333 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNDC10F2Z333 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNDC10F2Z333 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FNDC10F2Z333 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNDC10F2Z333 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNDC10F2Z333 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNDC10F2Z333 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNDC10F2Z333 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNDC10F2Z333 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FNDC10F2Z333 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNDC10F2Z333 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNDC10F2Z333 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNDC10F2Z333 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNDC10F2Z333 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNDC10F2Z333 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNDC10F2Z333 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNDC10F2Z333 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FNDC10F2Z333 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FNDC10F2Z333 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FNDC10F2Z333 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FNDC10F2Z333 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FNDC10F2Z333 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FNDC10F2Z333 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FNDC10F2Z333 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FNDC10F2Z333 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FNDC10F2Z333 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FNDC10F2Z333 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FNDC10F2Z333 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FNDC10F2Z333 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNDC10F2Z333 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FNDC10F2Z333 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNDC10F2Z333 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FNDC10F2Z333 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FNDC10F2Z333 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FNDC10F2Z333 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FNDC10F2Z333 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FNDC10F2Z333 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms