Protein–RNA interactions for Protein: B6A8C7

TARM1, T-cell-interacting, activating receptor on myeloid cells protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARM1B6A8C7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TARM1B6A8C7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TARM1B6A8C7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TARM1B6A8C7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TARM1B6A8C7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TARM1B6A8C7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TARM1B6A8C7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TARM1B6A8C7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TARM1B6A8C7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TARM1B6A8C7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TARM1B6A8C7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TARM1B6A8C7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TARM1B6A8C7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TARM1B6A8C7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TARM1B6A8C7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TARM1B6A8C7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TARM1B6A8C7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TARM1B6A8C7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TARM1B6A8C7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TARM1B6A8C7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TARM1B6A8C7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TARM1B6A8C7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TARM1B6A8C7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TARM1B6A8C7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TARM1B6A8C7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TARM1B6A8C7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TARM1B6A8C7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TARM1B6A8C7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TARM1B6A8C7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TARM1B6A8C7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TARM1B6A8C7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TARM1B6A8C7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TARM1B6A8C7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TARM1B6A8C7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TARM1B6A8C7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TARM1B6A8C7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TARM1B6A8C7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TARM1B6A8C7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TARM1B6A8C7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TARM1B6A8C7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TARM1B6A8C7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TARM1B6A8C7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TARM1B6A8C7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TARM1B6A8C7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TARM1B6A8C7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TARM1B6A8C7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TARM1B6A8C7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TARM1B6A8C7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TARM1B6A8C7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TARM1B6A8C7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TARM1B6A8C7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TARM1B6A8C7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TARM1B6A8C7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TARM1B6A8C7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TARM1B6A8C7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TARM1B6A8C7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TARM1B6A8C7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TARM1B6A8C7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TARM1B6A8C7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TARM1B6A8C7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TARM1B6A8C7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TARM1B6A8C7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TARM1B6A8C7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TARM1B6A8C7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TARM1B6A8C7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TARM1B6A8C7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TARM1B6A8C7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TARM1B6A8C7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TARM1B6A8C7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TARM1B6A8C7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TARM1B6A8C7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TARM1B6A8C7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TARM1B6A8C7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TARM1B6A8C7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TARM1B6A8C7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TARM1B6A8C7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TARM1B6A8C7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TARM1B6A8C7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TARM1B6A8C7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TARM1B6A8C7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TARM1B6A8C7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TARM1B6A8C7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TARM1B6A8C7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TARM1B6A8C7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TARM1B6A8C7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TARM1B6A8C7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TARM1B6A8C7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TARM1B6A8C7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TARM1B6A8C7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TARM1B6A8C7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TARM1B6A8C7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TARM1B6A8C7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TARM1B6A8C7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TARM1B6A8C7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TARM1B6A8C7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TARM1B6A8C7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TARM1B6A8C7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TARM1B6A8C7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TARM1B6A8C7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TARM1B6A8C7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms