Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YX44

TRBV5-5, T-cell receptor beta variable 5-5 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-5A0A0J9YX44 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRBV5-5A0A0J9YX44 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRBV5-5A0A0J9YX44 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRBV5-5A0A0J9YX44 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRBV5-5A0A0J9YX44 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRBV5-5A0A0J9YX44 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRBV5-5A0A0J9YX44 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRBV5-5A0A0J9YX44 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRBV5-5A0A0J9YX44 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRBV5-5A0A0J9YX44 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRBV5-5A0A0J9YX44 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRBV5-5A0A0J9YX44 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRBV5-5A0A0J9YX44 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRBV5-5A0A0J9YX44 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRBV5-5A0A0J9YX44 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRBV5-5A0A0J9YX44 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRBV5-5A0A0J9YX44 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRBV5-5A0A0J9YX44 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRBV5-5A0A0J9YX44 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRBV5-5A0A0J9YX44 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRBV5-5A0A0J9YX44 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRBV5-5A0A0J9YX44 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRBV5-5A0A0J9YX44 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRBV5-5A0A0J9YX44 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRBV5-5A0A0J9YX44 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRBV5-5A0A0J9YX44 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRBV5-5A0A0J9YX44 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRBV5-5A0A0J9YX44 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRBV5-5A0A0J9YX44 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRBV5-5A0A0J9YX44 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRBV5-5A0A0J9YX44 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRBV5-5A0A0J9YX44 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRBV5-5A0A0J9YX44 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRBV5-5A0A0J9YX44 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRBV5-5A0A0J9YX44 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRBV5-5A0A0J9YX44 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRBV5-5A0A0J9YX44 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRBV5-5A0A0J9YX44 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRBV5-5A0A0J9YX44 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRBV5-5A0A0J9YX44 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRBV5-5A0A0J9YX44 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRBV5-5A0A0J9YX44 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRBV5-5A0A0J9YX44 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRBV5-5A0A0J9YX44 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRBV5-5A0A0J9YX44 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRBV5-5A0A0J9YX44 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRBV5-5A0A0J9YX44 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRBV5-5A0A0J9YX44 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRBV5-5A0A0J9YX44 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRBV5-5A0A0J9YX44 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRBV5-5A0A0J9YX44 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
TRBV5-5A0A0J9YX44 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRBV5-5A0A0J9YX44 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRBV5-5A0A0J9YX44 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRBV5-5A0A0J9YX44 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRBV5-5A0A0J9YX44 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRBV5-5A0A0J9YX44 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRBV5-5A0A0J9YX44 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRBV5-5A0A0J9YX44 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRBV5-5A0A0J9YX44 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRBV5-5A0A0J9YX44 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRBV5-5A0A0J9YX44 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRBV5-5A0A0J9YX44 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRBV5-5A0A0J9YX44 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRBV5-5A0A0J9YX44 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRBV5-5A0A0J9YX44 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRBV5-5A0A0J9YX44 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRBV5-5A0A0J9YX44 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRBV5-5A0A0J9YX44 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRBV5-5A0A0J9YX44 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRBV5-5A0A0J9YX44 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRBV5-5A0A0J9YX44 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRBV5-5A0A0J9YX44 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRBV5-5A0A0J9YX44 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRBV5-5A0A0J9YX44 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRBV5-5A0A0J9YX44 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRBV5-5A0A0J9YX44 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRBV5-5A0A0J9YX44 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRBV5-5A0A0J9YX44 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRBV5-5A0A0J9YX44 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRBV5-5A0A0J9YX44 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRBV5-5A0A0J9YX44 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRBV5-5A0A0J9YX44 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRBV5-5A0A0J9YX44 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRBV5-5A0A0J9YX44 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRBV5-5A0A0J9YX44 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRBV5-5A0A0J9YX44 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRBV5-5A0A0J9YX44 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRBV5-5A0A0J9YX44 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRBV5-5A0A0J9YX44 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRBV5-5A0A0J9YX44 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRBV5-5A0A0J9YX44 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRBV5-5A0A0J9YX44 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRBV5-5A0A0J9YX44 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRBV5-5A0A0J9YX44 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRBV5-5A0A0J9YX44 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRBV5-5A0A0J9YX44 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRBV5-5A0A0J9YX44 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRBV5-5A0A0J9YX44 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRBV5-5A0A0J9YX44 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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