Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP59

SLC40A1, Solute carrier family 40 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC40A1Q9NP59 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC40A1Q9NP59 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC40A1Q9NP59 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC40A1Q9NP59 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC40A1Q9NP59 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC40A1Q9NP59 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC40A1Q9NP59 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC40A1Q9NP59 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC40A1Q9NP59 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC40A1Q9NP59 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC40A1Q9NP59 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC40A1Q9NP59 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC40A1Q9NP59 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC40A1Q9NP59 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC40A1Q9NP59 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC40A1Q9NP59 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC40A1Q9NP59 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC40A1Q9NP59 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC40A1Q9NP59 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC40A1Q9NP59 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC40A1Q9NP59 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC40A1Q9NP59 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC40A1Q9NP59 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC40A1Q9NP59 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC40A1Q9NP59 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC40A1Q9NP59 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC40A1Q9NP59 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC40A1Q9NP59 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC40A1Q9NP59 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC40A1Q9NP59 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC40A1Q9NP59 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC40A1Q9NP59 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC40A1Q9NP59 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC40A1Q9NP59 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC40A1Q9NP59 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC40A1Q9NP59 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC40A1Q9NP59 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC40A1Q9NP59 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC40A1Q9NP59 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC40A1Q9NP59 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC40A1Q9NP59 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC40A1Q9NP59 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC40A1Q9NP59 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC40A1Q9NP59 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC40A1Q9NP59 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC40A1Q9NP59 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC40A1Q9NP59 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC40A1Q9NP59 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC40A1Q9NP59 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC40A1Q9NP59 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC40A1Q9NP59 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC40A1Q9NP59 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC40A1Q9NP59 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC40A1Q9NP59 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC40A1Q9NP59 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC40A1Q9NP59 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC40A1Q9NP59 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC40A1Q9NP59 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC40A1Q9NP59 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC40A1Q9NP59 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC40A1Q9NP59 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC40A1Q9NP59 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC40A1Q9NP59 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC40A1Q9NP59 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC40A1Q9NP59 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SLC40A1Q9NP59 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC40A1Q9NP59 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC40A1Q9NP59 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC40A1Q9NP59 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC40A1Q9NP59 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC40A1Q9NP59 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC40A1Q9NP59 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC40A1Q9NP59 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC40A1Q9NP59 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC40A1Q9NP59 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC40A1Q9NP59 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC40A1Q9NP59 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC40A1Q9NP59 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC40A1Q9NP59 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC40A1Q9NP59 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC40A1Q9NP59 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC40A1Q9NP59 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC40A1Q9NP59 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC40A1Q9NP59 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC40A1Q9NP59 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC40A1Q9NP59 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC40A1Q9NP59 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC40A1Q9NP59 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC40A1Q9NP59 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC40A1Q9NP59 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC40A1Q9NP59 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC40A1Q9NP59 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC40A1Q9NP59 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC40A1Q9NP59 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC40A1Q9NP59 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC40A1Q9NP59 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC40A1Q9NP59 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC40A1Q9NP59 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC40A1Q9NP59 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC40A1Q9NP59 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms