Protein–RNA interactions for Protein: O75901

RASSF9, Ras association domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF9O75901 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RASSF9O75901 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RASSF9O75901 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RASSF9O75901 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RASSF9O75901 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RASSF9O75901 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RASSF9O75901 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RASSF9O75901 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RASSF9O75901 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RASSF9O75901 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RASSF9O75901 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RASSF9O75901 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RASSF9O75901 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RASSF9O75901 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RASSF9O75901 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RASSF9O75901 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RASSF9O75901 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RASSF9O75901 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RASSF9O75901 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RASSF9O75901 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RASSF9O75901 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RASSF9O75901 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RASSF9O75901 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RASSF9O75901 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RASSF9O75901 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RASSF9O75901 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RASSF9O75901 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RASSF9O75901 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RASSF9O75901 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RASSF9O75901 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RASSF9O75901 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RASSF9O75901 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RASSF9O75901 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RASSF9O75901 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RASSF9O75901 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RASSF9O75901 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RASSF9O75901 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RASSF9O75901 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RASSF9O75901 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RASSF9O75901 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RASSF9O75901 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RASSF9O75901 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RASSF9O75901 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RASSF9O75901 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RASSF9O75901 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RASSF9O75901 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RASSF9O75901 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RASSF9O75901 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RASSF9O75901 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RASSF9O75901 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RASSF9O75901 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RASSF9O75901 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RASSF9O75901 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RASSF9O75901 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RASSF9O75901 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RASSF9O75901 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RASSF9O75901 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RASSF9O75901 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RASSF9O75901 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RASSF9O75901 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RASSF9O75901 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RASSF9O75901 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RASSF9O75901 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RASSF9O75901 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RASSF9O75901 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RASSF9O75901 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RASSF9O75901 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RASSF9O75901 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RASSF9O75901 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RASSF9O75901 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RASSF9O75901 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RASSF9O75901 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RASSF9O75901 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RASSF9O75901 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RASSF9O75901 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RASSF9O75901 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RASSF9O75901 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RASSF9O75901 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RASSF9O75901 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RASSF9O75901 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RASSF9O75901 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RASSF9O75901 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RASSF9O75901 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RASSF9O75901 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RASSF9O75901 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RASSF9O75901 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RASSF9O75901 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RASSF9O75901 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RASSF9O75901 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RASSF9O75901 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RASSF9O75901 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RASSF9O75901 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RASSF9O75901 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
RASSF9O75901 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RASSF9O75901 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RASSF9O75901 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RASSF9O75901 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RASSF9O75901 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RASSF9O75901 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RASSF9O75901 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms