Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCNI2Q6ZMN8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCNI2Q6ZMN8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCNI2Q6ZMN8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCNI2Q6ZMN8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
CCNI2Q6ZMN8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CCNI2Q6ZMN8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCNI2Q6ZMN8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCNI2Q6ZMN8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCNI2Q6ZMN8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCNI2Q6ZMN8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCNI2Q6ZMN8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCNI2Q6ZMN8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCNI2Q6ZMN8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCNI2Q6ZMN8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCNI2Q6ZMN8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCNI2Q6ZMN8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCNI2Q6ZMN8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCNI2Q6ZMN8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCNI2Q6ZMN8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCNI2Q6ZMN8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCNI2Q6ZMN8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCNI2Q6ZMN8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCNI2Q6ZMN8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCNI2Q6ZMN8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCNI2Q6ZMN8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCNI2Q6ZMN8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCNI2Q6ZMN8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCNI2Q6ZMN8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCNI2Q6ZMN8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCNI2Q6ZMN8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCNI2Q6ZMN8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCNI2Q6ZMN8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCNI2Q6ZMN8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCNI2Q6ZMN8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCNI2Q6ZMN8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCNI2Q6ZMN8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CCNI2Q6ZMN8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCNI2Q6ZMN8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCNI2Q6ZMN8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CCNI2Q6ZMN8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCNI2Q6ZMN8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCNI2Q6ZMN8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCNI2Q6ZMN8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCNI2Q6ZMN8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCNI2Q6ZMN8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCNI2Q6ZMN8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCNI2Q6ZMN8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCNI2Q6ZMN8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCNI2Q6ZMN8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CCNI2Q6ZMN8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCNI2Q6ZMN8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCNI2Q6ZMN8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCNI2Q6ZMN8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCNI2Q6ZMN8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCNI2Q6ZMN8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCNI2Q6ZMN8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCNI2Q6ZMN8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCNI2Q6ZMN8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCNI2Q6ZMN8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCNI2Q6ZMN8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCNI2Q6ZMN8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCNI2Q6ZMN8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCNI2Q6ZMN8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCNI2Q6ZMN8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCNI2Q6ZMN8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCNI2Q6ZMN8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCNI2Q6ZMN8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CCNI2Q6ZMN8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCNI2Q6ZMN8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCNI2Q6ZMN8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCNI2Q6ZMN8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCNI2Q6ZMN8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCNI2Q6ZMN8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCNI2Q6ZMN8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCNI2Q6ZMN8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCNI2Q6ZMN8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCNI2Q6ZMN8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCNI2Q6ZMN8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCNI2Q6ZMN8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCNI2Q6ZMN8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCNI2Q6ZMN8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCNI2Q6ZMN8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCNI2Q6ZMN8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCNI2Q6ZMN8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCNI2Q6ZMN8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCNI2Q6ZMN8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCNI2Q6ZMN8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCNI2Q6ZMN8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCNI2Q6ZMN8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCNI2Q6ZMN8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCNI2Q6ZMN8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCNI2Q6ZMN8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCNI2Q6ZMN8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCNI2Q6ZMN8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCNI2Q6ZMN8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCNI2Q6ZMN8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCNI2Q6ZMN8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCNI2Q6ZMN8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCNI2Q6ZMN8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms