RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449319.2

FAM89B-202, Transcript of family with sequence similarity 89 member B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM89B, Length 1,337 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM89B-202ENST00000449319 NISCHQ9Y2I1 1504 aa72.3■■■■■ 9.16
FAM89B-202ENST00000449319 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa64.23■■■■■ 7.87
FAM89B-202ENST00000449319 ABCC9O60706 1549 aa63.36■■■■■ 7.73
FAM89B-202ENST00000449319 DCAF8L2P0C7V8 631 aa60.82■■■■■ 7.33
FAM89B-202ENST00000449319 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa60.65■■■■■ 7.3
FAM89B-202ENST00000449319 NACADO15069 1562 aa60.5■■■■■ 7.27
FAM89B-202ENST00000449319 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP60.14■■■■■ 7.22
FAM89B-202ENST00000449319 MYO15BQ96JP2 1530 aa59.95■■■■■ 7.19
FAM89B-202ENST00000449319 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa59.65■■■■■ 7.14
FAM89B-202ENST00000449319 UNC13AQ9UPW8 1703 aa59.34■■■■■ 7.09
FAM89B-202ENST00000449319 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP59.29■■■■■ 7.08
FAM89B-202ENST00000449319 BICRAQ9NZM4 1560 aa58.91■■■■■ 7.02
FAM89B-202ENST00000449319 SCRIBQ14160 1630 aa58.82■■■■■ 7.01
FAM89B-202ENST00000449319 DNAJC5BQ9UF47 199 aa58.49■■■■■ 6.95
FAM89B-202ENST00000449319 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa58■■■■■ 6.88
FAM89B-202ENST00000449319 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP57.34■■■■■ 6.77
FAM89B-202ENST00000449319 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa57.21■■■■■ 6.75
FAM89B-202ENST00000449319 CECR2Q9BXF3 1484 aa56.89■■■■■ 6.7
FAM89B-202ENST00000449319 SMARCA4P51532 1647 aa56.14■■■■■ 6.58
FAM89B-202ENST00000449319 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP55.99■■■■■ 6.55
FAM89B-202ENST00000449319 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa55.93■■■■■ 6.54
FAM89B-202ENST00000449319 NCAPD3P42695 1498 aa55.87■■■■■ 6.53
FAM89B-202ENST00000449319 MROH2BQ7Z745 1585 aa55.8■■■■■ 6.52
FAM89B-202ENST00000449319 SMARCA2P51531 1590 aa55.76■■■■■ 6.52
FAM89B-202ENST00000449319 HMGXB3Q12766 1538 aa55.51■■■■■ 6.48
FAM89B-202ENST00000449319 PEG3Q9GZU2 1588 aa55.49■■■■■ 6.47
FAM89B-202ENST00000449319 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP55.45■■■■■ 6.47
FAM89B-202ENST00000449319 WIZO95785 1651 aa55.19■■■■■ 6.43
FAM89B-202ENST00000449319 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP55.06■■■■■ 6.4
FAM89B-202ENST00000449319 NESP48681 1621 aa54.78■■■■■ 6.36
FAM89B-202ENST00000449319 ERCC6Q03468 1493 aa54.57■■■■■ 6.33
FAM89B-202ENST00000449319 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP54.49■■■■■ 6.31
FAM89B-202ENST00000449319 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa54.39■■■■■ 6.3
FAM89B-202ENST00000449319 CADPSQ9ULU8 1353 aa54.29■■■■■ 6.28
FAM89B-202ENST00000449319 PDS5BQ9NTI5 1447 aa54.09■■■■■ 6.25
FAM89B-202ENST00000449319 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa54.03■■■■■ 6.24
FAM89B-202ENST00000449319 CCDC88BA6NC98 1476 aa53.95■■■■■ 6.23
FAM89B-202ENST00000449319 CUX2O14529 1486 aa53.94■■■■■ 6.23
FAM89B-202ENST00000449319 CFTRP13569 1480 aa53.87■■■■■ 6.22
FAM89B-202ENST00000449319 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP53.84■■■■■ 6.21
FAM89B-202ENST00000449319 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP53.71■■■■■ 6.19
FAM89B-202ENST00000449319 FANCD2Q9BXW9 1451 aa53.68■■■■■ 6.18
FAM89B-202ENST00000449319 CEP164Q9UPV0 1460 aa53.6■■■■■ 6.17
FAM89B-202ENST00000449319 MRC2Q9UBG0 1479 aa53.57■■■■■ 6.17
FAM89B-202ENST00000449319 PRDM2Q13029 1718 aa53.36■■■■■ 6.13
FAM89B-202ENST00000449319 WDR62O43379 1518 aa53.36■■■■■ 6.13
FAM89B-202ENST00000449319 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP53.19■■■■■ 6.1
FAM89B-202ENST00000449319 TOPBP1Q92547 1522 aa52.79■■■■■ 6.04
FAM89B-202ENST00000449319 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa52.72■■■■■ 6.03
FAM89B-202ENST00000449319 DNMBPQ6XZF7 1577 aa52.66■■■■■ 6.02
FAM89B-202ENST00000449319 ABCC8Q09428 1581 aa52.65■■■■■ 6.02
FAM89B-202ENST00000449319 IFT140Q96RY7 1462 aa52.47■■■■■ 5.99
FAM89B-202ENST00000449319 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP52.38■■■■■ 5.98
FAM89B-202ENST00000449319 CUX1P39880 1505 aa52.33■■■■■ 5.97
FAM89B-202ENST00000449319 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP52.33■■■■■ 5.97
FAM89B-202ENST00000449319 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa52.22■■■■■ 5.95
FAM89B-202ENST00000449319 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP52.2■■■■■ 5.95
FAM89B-202ENST00000449319 FGD5Q6ZNL6 1462 aa52.19■■■■■ 5.95
FAM89B-202ENST00000449319 SOGA1O94964 1423 aa52.16■■■■■ 5.94
FAM89B-202ENST00000449319 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP52.08■■■■■ 5.93
FAM89B-202ENST00000449319 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP52.05■■■■■ 5.92
FAM89B-202ENST00000449319 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP51.97■■■■■ 5.91
FAM89B-202ENST00000449319 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP51.9■■■■■ 5.9
FAM89B-202ENST00000449319 OSCARQ8IYS5 282 aa51.82■■■■■ 5.89
FAM89B-202ENST00000449319 SYNJ1O43426 1573 aa51.81■■■■■ 5.88
FAM89B-202ENST00000449319 TOP2BQ02880 1626 aa51.75■■■■■ 5.87
FAM89B-202ENST00000449319 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa51.73■■■■■ 5.87
FAM89B-202ENST00000449319 WDR97A6NE52 1622 aa51.67■■■■■ 5.86
FAM89B-202ENST00000449319 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa51.6■■■■■ 5.85
FAM89B-202ENST00000449319 FBLN2P98095 1184 aa51.59■■■■■ 5.85
FAM89B-202ENST00000449319 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa51.52■■■■■ 5.84
FAM89B-202ENST00000449319 GAPVD1Q14C86 1478 aa51.51■■■■■ 5.84
FAM89B-202ENST00000449319 GRIN2BQ13224 1484 aa51.5■■■■■ 5.84
FAM89B-202ENST00000449319 CHD1O14646 1710 aa51.48■■■■■ 5.83
FAM89B-202ENST00000449319 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa51.4■■■■■ 5.82
FAM89B-202ENST00000449319 PBRM1Q86U86 1689 aa51.38■■■■■ 5.81
FAM89B-202ENST00000449319 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP51.34■■■■■ 5.81
FAM89B-202ENST00000449319 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP51.32■■■■■ 5.81
FAM89B-202ENST00000449319 SYNJ2O15056 1496 aa51.18■■■■■ 5.78
FAM89B-202ENST00000449319 TRIM41Q8WV44 630 aa51.06■■■■■ 5.76
FAM89B-202ENST00000449319 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa50.98■■■■■ 5.75
FAM89B-202ENST00000449319 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa50.98■■■■■ 5.75
FAM89B-202ENST00000449319 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa50.98■■■■■ 5.75
FAM89B-202ENST00000449319 ERICH3Q5RHP9 1530 aa50.95■■■■■ 5.75
FAM89B-202ENST00000449319 ADAMTS12P58397 1594 aa50.95■■■■■ 5.75
FAM89B-202ENST00000449319 ARHGEF11O15085 1522 aa50.93■■■■■ 5.74
FAM89B-202ENST00000449319 FHAD1B1AJZ9 1412 aa50.87■■■■■ 5.73
FAM89B-202ENST00000449319 CLASP1Q7Z460 1538 aa50.86■■■■■ 5.73
FAM89B-202ENST00000449319 GRIN2AQ12879 1464 aa50.85■■■■■ 5.73
FAM89B-202ENST00000449319 KIF27Q86VH2 1401 aa50.81■■■■■ 5.72
FAM89B-202ENST00000449319 IGF1RP08069 1367 aa50.71■■■■■ 5.71
FAM89B-202ENST00000449319 CYB5RLQ6IPT4 315 aa50.63■■■■■ 5.7
FAM89B-202ENST00000449319 CEP170Q5SW79 1584 aa50.63■■■■■ 5.7
FAM89B-202ENST00000449319 NUP160Q12769 1436 aa50.61■■■■■ 5.69
FAM89B-202ENST00000449319 ARAP1Q96P48 1450 aa50.53■■■■■ 5.68
FAM89B-202ENST00000449319 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa50.46■■■■■ 5.67
FAM89B-202ENST00000449319 CUL7Q14999 1698 aa50.42■■■■■ 5.66
FAM89B-202ENST00000449319 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa50.4■■■■■ 5.66
FAM89B-202ENST00000449319 ERCC6L2Q5T890 1561 aa50.3■■■■■ 5.64
FAM89B-202ENST00000449319 JPH4Q96JJ6 628 aa50.22■■■■■ 5.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms