RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 NISCHQ9Y2I1 1504 aa69.92■■■■■ 8.78
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa61.72■■■■■ 7.47
ECHS1-201ENST00000368547 ABCC9O60706 1549 aa59.47■■■■■ 7.11
ECHS1-201ENST00000368547 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP58.46■■■■■ 6.95
ECHS1-201ENST00000368547 DCAF8L2P0C7V8 631 aa58.09■■■■■ 6.89
ECHS1-201ENST00000368547 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa57.85■■■■■ 6.85
ECHS1-201ENST00000368547 NACADO15069 1562 aa57.77■■■■■ 6.84
ECHS1-201ENST00000368547 MYO15BQ96JP2 1530 aa57.71■■■■■ 6.83
ECHS1-201ENST00000368547 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa57.61■■■■■ 6.81
ECHS1-201ENST00000368547 SCRIBQ14160 1630 aa56.47■■■■■ 6.63
ECHS1-201ENST00000368547 UNC13AQ9UPW8 1703 aa56.43■■■■■ 6.62
ECHS1-201ENST00000368547 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa55.94■■■■■ 6.55
ECHS1-201ENST00000368547 BICRAQ9NZM4 1560 aa55.86■■■■■ 6.53
ECHS1-201ENST00000368547 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP55.75■■■■■ 6.52
ECHS1-201ENST00000368547 CECR2Q9BXF3 1484 aa54.39■■■■■ 6.3
ECHS1-201ENST00000368547 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP54.29■■■■■ 6.28
ECHS1-201ENST00000368547 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP54.12■■■■■ 6.25
ECHS1-201ENST00000368547 SMARCA4P51532 1647 aa54.07■■■■■ 6.25
ECHS1-201ENST00000368547 MROH2BQ7Z745 1585 aa53.94■■■■■ 6.23
ECHS1-201ENST00000368547 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.84■■■■■ 6.21
ECHS1-201ENST00000368547 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.67■■■■■ 6.18
ECHS1-201ENST00000368547 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP53.66■■■■■ 6.18
ECHS1-201ENST00000368547 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa53.49■■■■■ 6.15
ECHS1-201ENST00000368547 PEG3Q9GZU2 1588 aa53.48■■■■■ 6.15
ECHS1-201ENST00000368547 SMARCA2P51531 1590 aa53.47■■■■■ 6.15
ECHS1-201ENST00000368547 WIZO95785 1651 aa53.45■■■■■ 6.15
ECHS1-201ENST00000368547 NCAPD3P42695 1498 aa53.28■■■■■ 6.12
ECHS1-201ENST00000368547 HMGXB3Q12766 1538 aa53.13■■■■■ 6.1
ECHS1-201ENST00000368547 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP53.13■■■■■ 6.1
ECHS1-201ENST00000368547 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP53.13■■■■■ 6.1
ECHS1-201ENST00000368547 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP52.88■■■■■ 6.06
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC88BA6NC98 1476 aa52.27■■■■■ 5.96
ECHS1-201ENST00000368547 CADPSQ9ULU8 1353 aa51.79■■■■■ 5.88
ECHS1-201ENST00000368547 NESP48681 1621 aa51.77■■■■■ 5.88
ECHS1-201ENST00000368547 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa51.75■■■■■ 5.87
ECHS1-201ENST00000368547 CFTRP13569 1480 aa51.71■■■■■ 5.87
ECHS1-201ENST00000368547 PRDM2Q13029 1718 aa51.47■■■■■ 5.83
ECHS1-201ENST00000368547 PDS5BQ9NTI5 1447 aa51.34■■■■■ 5.81
ECHS1-201ENST00000368547 FANCD2Q9BXW9 1451 aa51.23■■■■■ 5.79
ECHS1-201ENST00000368547 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa51.23■■■■■ 5.79
ECHS1-201ENST00000368547 ERCC6Q03468 1493 aa51.17■■■■■ 5.78
ECHS1-201ENST00000368547 CEP164Q9UPV0 1460 aa51.06■■■■■ 5.76
ECHS1-201ENST00000368547 MRC2Q9UBG0 1479 aa50.77■■■■■ 5.72
ECHS1-201ENST00000368547 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.76■■■■■ 5.72
ECHS1-201ENST00000368547 ABCC8Q09428 1581 aa50.72■■■■■ 5.71
ECHS1-201ENST00000368547 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP50.67■■■■■ 5.7
ECHS1-201ENST00000368547 WDR62O43379 1518 aa50.58■■■■■ 5.69
ECHS1-201ENST00000368547 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP50.57■■■■■ 5.69
ECHS1-201ENST00000368547 DNMBPQ6XZF7 1577 aa50.55■■■■■ 5.68
ECHS1-201ENST00000368547 CUX1P39880 1505 aa50.54■■■■■ 5.68
ECHS1-201ENST00000368547 TOPBP1Q92547 1522 aa50.53■■■■■ 5.68
ECHS1-201ENST00000368547 SYNJ1O43426 1573 aa50.44■■■■■ 5.66
ECHS1-201ENST00000368547 TOP2BQ02880 1626 aa50.36■■■■■ 5.65
ECHS1-201ENST00000368547 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa50.36■■■■■ 5.65
ECHS1-201ENST00000368547 CUX2O14529 1486 aa50.2■■■■■ 5.63
ECHS1-201ENST00000368547 FGD5Q6ZNL6 1462 aa50.2■■■■■ 5.63
ECHS1-201ENST00000368547 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP50.17■■■■■ 5.62
ECHS1-201ENST00000368547 CHIC1Q5VXU3 224 aa50.13■■■■■ 5.62
ECHS1-201ENST00000368547 TRIM41Q8WV44 630 aa50.09■■■■■ 5.61
ECHS1-201ENST00000368547 SOGA1O94964 1423 aa49.97■■■■■ 5.59
ECHS1-201ENST00000368547 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa49.97■■■■■ 5.59
ECHS1-201ENST00000368547 IFT140Q96RY7 1462 aa49.93■■■■■ 5.58
ECHS1-201ENST00000368547 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP49.91■■■■■ 5.58
ECHS1-201ENST00000368547 WDR97A6NE52 1622 aa49.77■■■■■ 5.56
ECHS1-201ENST00000368547 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa49.74■■■■■ 5.55
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP49.67■■■■■ 5.54
ECHS1-201ENST00000368547 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP49.59■■■■■ 5.53
ECHS1-201ENST00000368547 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP49.54■■■■■ 5.52
ECHS1-201ENST00000368547 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP49.52■■■■■ 5.523e-7■■■■□ 23.9
ECHS1-201ENST00000368547 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa49.48■■■■■ 5.51
ECHS1-201ENST00000368547 KIF27Q86VH2 1401 aa49.42■■■■■ 5.5
ECHS1-201ENST00000368547 GAPVD1Q14C86 1478 aa49.42■■■■■ 5.5
ECHS1-201ENST00000368547 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa49.35■■■■■ 5.49
ECHS1-201ENST00000368547 PBRM1Q86U86 1689 aa49.31■■■■■ 5.48
ECHS1-201ENST00000368547 GRIN2BQ13224 1484 aa49.25■■■■■ 5.48
ECHS1-201ENST00000368547 ERICH3Q5RHP9 1530 aa49.16■■■■■ 5.46
ECHS1-201ENST00000368547 EEA1Q15075 1411 aa49.11■■■■■ 5.45
ECHS1-201ENST00000368547 IGF1RP08069 1367 aa49.1■■■■■ 5.45
ECHS1-201ENST00000368547 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP49.09■■■■■ 5.45
ECHS1-201ENST00000368547 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa49.08■■■■■ 5.45
ECHS1-201ENST00000368547 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP49.02■■■■■ 5.44
ECHS1-201ENST00000368547 CUL7Q14999 1698 aa48.94■■■■■ 5.42
ECHS1-201ENST00000368547 CSRNP3Q8WYN3 585 aa48.94■■■■■ 5.42
ECHS1-201ENST00000368547 ADAMTS12P58397 1594 aa48.93■■■■■ 5.42
ECHS1-201ENST00000368547 FHAD1B1AJZ9 1412 aa48.86■■■■■ 5.41
ECHS1-201ENST00000368547 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa48.83■■■■■ 5.41
ECHS1-201ENST00000368547 SYNJ2O15056 1496 aa48.82■■■■■ 5.41
ECHS1-201ENST00000368547 CHD1O14646 1710 aa48.76■■■■■ 5.4
ECHS1-201ENST00000368547 FBLN2P98095 1184 aa48.75■■■■■ 5.39
ECHS1-201ENST00000368547 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP48.73■■■■■ 5.39
ECHS1-201ENST00000368547 PRXQ9BXM0 1461 aa48.72■■■■■ 5.39
ECHS1-201ENST00000368547 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa48.66■■■■■ 5.38
ECHS1-201ENST00000368547 GRIN2AQ12879 1464 aa48.64■■■■■ 5.38
ECHS1-201ENST00000368547 KIF21BO75037 1637 aa48.58■■■■■ 5.37
ECHS1-201ENST00000368547 EHMT2Q96KQ7 1210 aa48.42■■■■■ 5.34
ECHS1-201ENST00000368547 CEP170Q5SW79 1584 aa48.39■■■■■ 5.34
ECHS1-201ENST00000368547 GOLGA3Q08378 1498 aa48.36■■■■■ 5.33
ECHS1-201ENST00000368547 NUP160Q12769 1436 aa48.36■■■■■ 5.33
ECHS1-201ENST00000368547 OSCARQ8IYS5 282 aa48.33■■■■■ 5.33
ECHS1-201ENST00000368547 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa48.22■■■■■ 5.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms