Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ22

RAB12, Ras-related protein Rab-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB12Q6IQ22 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB12Q6IQ22 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB12Q6IQ22 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB12Q6IQ22 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB12Q6IQ22 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB12Q6IQ22 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB12Q6IQ22 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB12Q6IQ22 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB12Q6IQ22 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB12Q6IQ22 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB12Q6IQ22 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB12Q6IQ22 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB12Q6IQ22 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB12Q6IQ22 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB12Q6IQ22 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB12Q6IQ22 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB12Q6IQ22 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB12Q6IQ22 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB12Q6IQ22 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB12Q6IQ22 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB12Q6IQ22 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB12Q6IQ22 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB12Q6IQ22 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB12Q6IQ22 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB12Q6IQ22 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB12Q6IQ22 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB12Q6IQ22 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB12Q6IQ22 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB12Q6IQ22 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB12Q6IQ22 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB12Q6IQ22 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB12Q6IQ22 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB12Q6IQ22 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB12Q6IQ22 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB12Q6IQ22 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB12Q6IQ22 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB12Q6IQ22 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB12Q6IQ22 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB12Q6IQ22 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB12Q6IQ22 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB12Q6IQ22 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB12Q6IQ22 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB12Q6IQ22 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB12Q6IQ22 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB12Q6IQ22 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB12Q6IQ22 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB12Q6IQ22 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB12Q6IQ22 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB12Q6IQ22 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB12Q6IQ22 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB12Q6IQ22 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB12Q6IQ22 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB12Q6IQ22 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB12Q6IQ22 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB12Q6IQ22 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB12Q6IQ22 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB12Q6IQ22 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB12Q6IQ22 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB12Q6IQ22 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB12Q6IQ22 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB12Q6IQ22 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB12Q6IQ22 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB12Q6IQ22 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB12Q6IQ22 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB12Q6IQ22 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB12Q6IQ22 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB12Q6IQ22 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB12Q6IQ22 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB12Q6IQ22 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB12Q6IQ22 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB12Q6IQ22 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB12Q6IQ22 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB12Q6IQ22 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB12Q6IQ22 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB12Q6IQ22 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB12Q6IQ22 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB12Q6IQ22 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB12Q6IQ22 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB12Q6IQ22 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB12Q6IQ22 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB12Q6IQ22 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB12Q6IQ22 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB12Q6IQ22 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB12Q6IQ22 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB12Q6IQ22 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB12Q6IQ22 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB12Q6IQ22 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB12Q6IQ22 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB12Q6IQ22 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB12Q6IQ22 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB12Q6IQ22 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB12Q6IQ22 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB12Q6IQ22 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB12Q6IQ22 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB12Q6IQ22 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB12Q6IQ22 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB12Q6IQ22 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB12Q6IQ22 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB12Q6IQ22 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB12Q6IQ22 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms