Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ22

RAB12, Ras-related protein Rab-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB12Q6IQ22 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RAB12Q6IQ22 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAB12Q6IQ22 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAB12Q6IQ22 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAB12Q6IQ22 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAB12Q6IQ22 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAB12Q6IQ22 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB12Q6IQ22 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB12Q6IQ22 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB12Q6IQ22 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RAB12Q6IQ22 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAB12Q6IQ22 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB12Q6IQ22 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB12Q6IQ22 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB12Q6IQ22 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB12Q6IQ22 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB12Q6IQ22 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB12Q6IQ22 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB12Q6IQ22 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAB12Q6IQ22 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB12Q6IQ22 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB12Q6IQ22 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB12Q6IQ22 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB12Q6IQ22 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB12Q6IQ22 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB12Q6IQ22 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAB12Q6IQ22 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB12Q6IQ22 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB12Q6IQ22 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB12Q6IQ22 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB12Q6IQ22 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB12Q6IQ22 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB12Q6IQ22 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB12Q6IQ22 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB12Q6IQ22 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB12Q6IQ22 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB12Q6IQ22 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB12Q6IQ22 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB12Q6IQ22 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB12Q6IQ22 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB12Q6IQ22 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB12Q6IQ22 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB12Q6IQ22 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RAB12Q6IQ22 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB12Q6IQ22 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB12Q6IQ22 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB12Q6IQ22 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB12Q6IQ22 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB12Q6IQ22 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB12Q6IQ22 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB12Q6IQ22 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB12Q6IQ22 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB12Q6IQ22 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB12Q6IQ22 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB12Q6IQ22 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB12Q6IQ22 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB12Q6IQ22 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB12Q6IQ22 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB12Q6IQ22 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB12Q6IQ22 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB12Q6IQ22 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB12Q6IQ22 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB12Q6IQ22 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB12Q6IQ22 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB12Q6IQ22 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB12Q6IQ22 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB12Q6IQ22 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB12Q6IQ22 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB12Q6IQ22 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB12Q6IQ22 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB12Q6IQ22 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB12Q6IQ22 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB12Q6IQ22 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB12Q6IQ22 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB12Q6IQ22 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB12Q6IQ22 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB12Q6IQ22 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB12Q6IQ22 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB12Q6IQ22 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB12Q6IQ22 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB12Q6IQ22 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB12Q6IQ22 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB12Q6IQ22 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB12Q6IQ22 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB12Q6IQ22 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB12Q6IQ22 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB12Q6IQ22 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB12Q6IQ22 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB12Q6IQ22 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB12Q6IQ22 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB12Q6IQ22 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB12Q6IQ22 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB12Q6IQ22 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB12Q6IQ22 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB12Q6IQ22 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB12Q6IQ22 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB12Q6IQ22 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB12Q6IQ22 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB12Q6IQ22 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB12Q6IQ22 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms