Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LONRF1Q17RB8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LONRF1Q17RB8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LONRF1Q17RB8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LONRF1Q17RB8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LONRF1Q17RB8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LONRF1Q17RB8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LONRF1Q17RB8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LONRF1Q17RB8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LONRF1Q17RB8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LONRF1Q17RB8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LONRF1Q17RB8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LONRF1Q17RB8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LONRF1Q17RB8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LONRF1Q17RB8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LONRF1Q17RB8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
LONRF1Q17RB8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LONRF1Q17RB8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LONRF1Q17RB8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LONRF1Q17RB8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LONRF1Q17RB8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
LONRF1Q17RB8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LONRF1Q17RB8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LONRF1Q17RB8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LONRF1Q17RB8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LONRF1Q17RB8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LONRF1Q17RB8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LONRF1Q17RB8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LONRF1Q17RB8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LONRF1Q17RB8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LONRF1Q17RB8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LONRF1Q17RB8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LONRF1Q17RB8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LONRF1Q17RB8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LONRF1Q17RB8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LONRF1Q17RB8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LONRF1Q17RB8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LONRF1Q17RB8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LONRF1Q17RB8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LONRF1Q17RB8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LONRF1Q17RB8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LONRF1Q17RB8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
LONRF1Q17RB8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LONRF1Q17RB8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LONRF1Q17RB8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LONRF1Q17RB8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LONRF1Q17RB8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LONRF1Q17RB8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LONRF1Q17RB8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LONRF1Q17RB8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LONRF1Q17RB8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LONRF1Q17RB8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LONRF1Q17RB8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LONRF1Q17RB8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LONRF1Q17RB8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LONRF1Q17RB8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LONRF1Q17RB8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LONRF1Q17RB8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LONRF1Q17RB8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LONRF1Q17RB8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LONRF1Q17RB8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LONRF1Q17RB8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LONRF1Q17RB8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LONRF1Q17RB8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LONRF1Q17RB8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LONRF1Q17RB8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LONRF1Q17RB8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LONRF1Q17RB8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LONRF1Q17RB8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LONRF1Q17RB8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LONRF1Q17RB8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LONRF1Q17RB8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LONRF1Q17RB8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LONRF1Q17RB8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LONRF1Q17RB8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LONRF1Q17RB8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LONRF1Q17RB8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LONRF1Q17RB8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LONRF1Q17RB8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LONRF1Q17RB8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LONRF1Q17RB8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LONRF1Q17RB8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LONRF1Q17RB8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LONRF1Q17RB8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LONRF1Q17RB8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LONRF1Q17RB8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LONRF1Q17RB8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LONRF1Q17RB8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LONRF1Q17RB8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LONRF1Q17RB8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LONRF1Q17RB8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LONRF1Q17RB8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LONRF1Q17RB8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LONRF1Q17RB8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LONRF1Q17RB8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LONRF1Q17RB8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LONRF1Q17RB8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
LONRF1Q17RB8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LONRF1Q17RB8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LONRF1Q17RB8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
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