Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRNB3Q05901 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRNB3Q05901 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHRNB3Q05901 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHRNB3Q05901 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNB3Q05901 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHRNB3Q05901 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHRNB3Q05901 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNB3Q05901 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHRNB3Q05901 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHRNB3Q05901 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHRNB3Q05901 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNB3Q05901 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNB3Q05901 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHRNB3Q05901 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHRNB3Q05901 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHRNB3Q05901 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHRNB3Q05901 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHRNB3Q05901 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRNB3Q05901 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHRNB3Q05901 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRNB3Q05901 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRNB3Q05901 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRNB3Q05901 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRNB3Q05901 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRNB3Q05901 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRNB3Q05901 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNB3Q05901 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNB3Q05901 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNB3Q05901 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNB3Q05901 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNB3Q05901 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNB3Q05901 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNB3Q05901 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNB3Q05901 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNB3Q05901 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRNB3Q05901 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNB3Q05901 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNB3Q05901 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNB3Q05901 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNB3Q05901 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNB3Q05901 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNB3Q05901 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNB3Q05901 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRNB3Q05901 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRNB3Q05901 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRNB3Q05901 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHRNB3Q05901 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRNB3Q05901 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRNB3Q05901 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHRNB3Q05901 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHRNB3Q05901 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHRNB3Q05901 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHRNB3Q05901 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHRNB3Q05901 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHRNB3Q05901 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CHRNB3Q05901 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHRNB3Q05901 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHRNB3Q05901 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHRNB3Q05901 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHRNB3Q05901 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHRNB3Q05901 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRNB3Q05901 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRNB3Q05901 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHRNB3Q05901 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHRNB3Q05901 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNB3Q05901 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNB3Q05901 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNB3Q05901 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNB3Q05901 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNB3Q05901 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNB3Q05901 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNB3Q05901 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNB3Q05901 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNB3Q05901 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNB3Q05901 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNB3Q05901 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNB3Q05901 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNB3Q05901 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNB3Q05901 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNB3Q05901 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHRNB3Q05901 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHRNB3Q05901 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHRNB3Q05901 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRNB3Q05901 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRNB3Q05901 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRNB3Q05901 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHRNB3Q05901 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRNB3Q05901 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRNB3Q05901 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHRNB3Q05901 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHRNB3Q05901 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHRNB3Q05901 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHRNB3Q05901 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNB3Q05901 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNB3Q05901 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNB3Q05901 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNB3Q05901 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNB3Q05901 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNB3Q05901 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms