Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NAP1L1P55209 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NAP1L1P55209 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NAP1L1P55209 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NAP1L1P55209 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NAP1L1P55209 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NAP1L1P55209 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NAP1L1P55209 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NAP1L1P55209 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NAP1L1P55209 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NAP1L1P55209 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NAP1L1P55209 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NAP1L1P55209 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NAP1L1P55209 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NAP1L1P55209 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NAP1L1P55209 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NAP1L1P55209 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
NAP1L1P55209 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NAP1L1P55209 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NAP1L1P55209 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NAP1L1P55209 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NAP1L1P55209 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NAP1L1P55209 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NAP1L1P55209 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NAP1L1P55209 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NAP1L1P55209 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NAP1L1P55209 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NAP1L1P55209 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NAP1L1P55209 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NAP1L1P55209 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NAP1L1P55209 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NAP1L1P55209 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NAP1L1P55209 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NAP1L1P55209 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NAP1L1P55209 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NAP1L1P55209 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NAP1L1P55209 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NAP1L1P55209 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
NAP1L1P55209 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NAP1L1P55209 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NAP1L1P55209 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NAP1L1P55209 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NAP1L1P55209 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NAP1L1P55209 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NAP1L1P55209 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NAP1L1P55209 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NAP1L1P55209 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NAP1L1P55209 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NAP1L1P55209 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NAP1L1P55209 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NAP1L1P55209 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NAP1L1P55209 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NAP1L1P55209 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NAP1L1P55209 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NAP1L1P55209 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NAP1L1P55209 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NAP1L1P55209 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NAP1L1P55209 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NAP1L1P55209 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NAP1L1P55209 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NAP1L1P55209 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NAP1L1P55209 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NAP1L1P55209 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NAP1L1P55209 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NAP1L1P55209 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NAP1L1P55209 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NAP1L1P55209 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NAP1L1P55209 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NAP1L1P55209 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NAP1L1P55209 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NAP1L1P55209 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NAP1L1P55209 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NAP1L1P55209 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NAP1L1P55209 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NAP1L1P55209 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NAP1L1P55209 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NAP1L1P55209 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NAP1L1P55209 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NAP1L1P55209 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NAP1L1P55209 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NAP1L1P55209 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NAP1L1P55209 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NAP1L1P55209 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NAP1L1P55209 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NAP1L1P55209 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NAP1L1P55209 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NAP1L1P55209 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NAP1L1P55209 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NAP1L1P55209 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NAP1L1P55209 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NAP1L1P55209 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NAP1L1P55209 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NAP1L1P55209 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NAP1L1P55209 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NAP1L1P55209 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NAP1L1P55209 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NAP1L1P55209 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NAP1L1P55209 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NAP1L1P55209 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NAP1L1P55209 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms