RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393451.7

ST7-208, Transcript of suppression of tumorigenicity 7, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ST7, Length 2,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ST7-208	ENST00000393451	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		56.72	■■■■■ 6.67
ST7-208	ENST00000393451	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		48.21	■■■■■ 5.31
ST7-208	ENST00000393451	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	48.14	■■■■■ 5.3
ST7-208	ENST00000393451	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		48.13	■■■■■ 5.29
ST7-208	ENST00000393451	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	47.48	■■■■■ 5.19
ST7-208	ENST00000393451	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		46.82	■■■■■ 5.09
ST7-208	ENST00000393451	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		46.69	■■■■■ 5.07
ST7-208	ENST00000393451	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		46.58	■■■■■ 5.05
ST7-208	ENST00000393451	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		46.21	■■■■■ 4.99
ST7-208	ENST00000393451	HRC	P23327	699 aa		46.18	■■■■■ 4.98
ST7-208	ENST00000393451	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		45.54	■■■■■ 4.88
ST7-208	ENST00000393451	ABCC9	O60706	1549 aa		45.52	■■■■■ 4.88
ST7-208	ENST00000393451	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		45.06	■■■■■ 4.8
ST7-208	ENST00000393451	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	44.98	■■■■■ 4.79
ST7-208	ENST00000393451	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	44.87	■■■■■ 4.77
ST7-208	ENST00000393451	SCRIB	Q14160	1630 aa		44.85	■■■■■ 4.77
ST7-208	ENST00000393451	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	44.74	■■■■■ 4.75
ST7-208	ENST00000393451	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		44.71	■■■■■ 4.75
ST7-208	ENST00000393451	TRIM41	Q8WV44	630 aa		44.39	■■■■■ 4.7
ST7-208	ENST00000393451	NACAD	O15069	1562 aa		44.37	■■■■■ 4.69
ST7-208	ENST00000393451	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	44.3	■■■■■ 4.68
ST7-208	ENST00000393451	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		43.98	■■■■■ 4.63
ST7-208	ENST00000393451	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		43.98	■■■■■ 4.63
ST7-208	ENST00000393451	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	43.75	■■■■■ 4.59
ST7-208	ENST00000393451	WIZ	O95785	1651 aa		43.74	■■■■■ 4.59
ST7-208	ENST00000393451	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	43.74	■■■■■ 4.59
ST7-208	ENST00000393451	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	43.64	■■■■■ 4.58
ST7-208	ENST00000393451	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	43.27	■■■■■ 4.52
ST7-208	ENST00000393451	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		43.09	■■■■■ 4.49
ST7-208	ENST00000393451	SMARCA4	P51532	1647 aa		43.09	■■■■■ 4.49
ST7-208	ENST00000393451	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	43.07	■■■■■ 4.48	9e-6	■■■■■ 50.1
ST7-208	ENST00000393451	SMARCA2	P51531	1590 aa		42.98	■■■■■ 4.47
ST7-208	ENST00000393451	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		42.95	■■■■■ 4.47
ST7-208	ENST00000393451	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	42.87	■■■■■ 4.45
ST7-208	ENST00000393451	ABCC8	Q09428	1581 aa		42.85	■■■■■ 4.45
ST7-208	ENST00000393451	EEA1	Q15075	1411 aa		42.85	■■■■■ 4.45
ST7-208	ENST00000393451	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		42.76	■■■■■ 4.44
ST7-208	ENST00000393451	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		42.73	■■■■■ 4.43
ST7-208	ENST00000393451	CEP162	Q5TB80	1403 aa		42.73	■■■■■ 4.43
ST7-208	ENST00000393451	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	42.7	■■■■■ 4.43
ST7-208	ENST00000393451	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	42.7	■■■■■ 4.43
ST7-208	ENST00000393451	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	42.66	■■■■■ 4.42
ST7-208	ENST00000393451	SOGA1	O94964	1423 aa		42.57	■■■■■ 4.4
ST7-208	ENST00000393451	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		42.46	■■■■■ 4.39
ST7-208	ENST00000393451	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		42.43	■■■■■ 4.38
ST7-208	ENST00000393451	GOLGA3	Q08378	1498 aa		42.4	■■■■■ 4.38
ST7-208	ENST00000393451	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	42.28	■■■■■ 4.36
ST7-208	ENST00000393451	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		42.28	■■■■■ 4.36
ST7-208	ENST00000393451	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	42.22	■■■■■ 4.35
ST7-208	ENST00000393451	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	42.21	■■■■■ 4.35
ST7-208	ENST00000393451	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		42.2	■■■■■ 4.35
ST7-208	ENST00000393451	KIF21B	O75037	1637 aa		42.18	■■■■■ 4.34
ST7-208	ENST00000393451	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	42.14	■■■■■ 4.34
ST7-208	ENST00000393451	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		42.13	■■■■■ 4.34
ST7-208	ENST00000393451	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	42.04	■■■■■ 4.32
ST7-208	ENST00000393451	NEUROD1	Q13562	356 aa		42.02	■■■■■ 4.32
ST7-208	ENST00000393451	SYNJ1	O43426	1573 aa		41.99	■■■■■ 4.31
ST7-208	ENST00000393451	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	41.95	■■■■■ 4.31
ST7-208	ENST00000393451	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	41.92	■■■■■ 4.3
ST7-208	ENST00000393451	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	41.87	■■■■■ 4.29
ST7-208	ENST00000393451	CLIP1	P30622	1438 aa		41.84	■■■■■ 4.29
ST7-208	ENST00000393451	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		41.81	■■■■■ 4.28
ST7-208	ENST00000393451	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		41.81	■■■■■ 4.28
ST7-208	ENST00000393451	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		41.65	■■■■■ 4.26
ST7-208	ENST00000393451	TOP2B	Q02880	1626 aa		41.58	■■■■■ 4.25
ST7-208	ENST00000393451	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		41.57	■■■■■ 4.25
ST7-208	ENST00000393451	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		41.48	■■■■■ 4.23
ST7-208	ENST00000393451	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		41.45	■■■■■ 4.23
ST7-208	ENST00000393451	APLP2	Q06481	763 aa		41.44	■■■■■ 4.22
ST7-208	ENST00000393451	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	41.41	■■■■■ 4.22
ST7-208	ENST00000393451	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		41.34	■■■■■ 4.21
ST7-208	ENST00000393451	PRX	Q9BXM0	1461 aa		41.29	■■■■■ 4.2
ST7-208	ENST00000393451	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		41.2	■■■■■ 4.19
ST7-208	ENST00000393451	MIER1	Q8N108	512 aa		41.16	■■■■■ 4.18
ST7-208	ENST00000393451	ARAP1	Q96P48	1450 aa		41.14	■■■■■ 4.18
ST7-208	ENST00000393451	HMGXB3	Q12766	1538 aa		41.12	■■■■■ 4.17
ST7-208	ENST00000393451	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	41.01	■■■■■ 4.16
ST7-208	ENST00000393451	NCAPD3	P42695	1498 aa		41.01	■■■■■ 4.16
ST7-208	ENST00000393451	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	40.98	■■■■■ 4.15
ST7-208	ENST00000393451	MYT1	Q01538	1121 aa		40.94	■■■■■ 4.14
ST7-208	ENST00000393451	CUX1	P39880	1505 aa		40.94	■■■■■ 4.14
ST7-208	ENST00000393451	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	40.94	■■■■■ 4.14
ST7-208	ENST00000393451	KIF27	Q86VH2	1401 aa		40.93	■■■■■ 4.14
ST7-208	ENST00000393451	CUX2	O14529	1486 aa		40.93	■■■■■ 4.14
ST7-208	ENST00000393451	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	40.81	■■■■■ 4.12
ST7-208	ENST00000393451	CFTR	P13569	1480 aa		40.79	■■■■■ 4.12
ST7-208	ENST00000393451	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	40.76	■■■■■ 4.12
ST7-208	ENST00000393451	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		40.74	■■■■■ 4.11
ST7-208	ENST00000393451	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		40.7	■■■■■ 4.11
ST7-208	ENST00000393451	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		40.65	■■■■■ 4.1
ST7-208	ENST00000393451	MAP3K1	Q13233	1512 aa		40.63	■■■■■ 4.1
ST7-208	ENST00000393451	PRDM2	Q13029	1718 aa		40.62	■■■■■ 4.09
ST7-208	ENST00000393451	TIAM1	Q13009	1591 aa		40.43	■■■■■ 4.06
ST7-208	ENST00000393451	IGF1R	P08069	1367 aa		40.38	■■■■■ 4.05
ST7-208	ENST00000393451	MAPKBP1	O60336	1514 aa		40.29	■■■■■ 4.04
ST7-208	ENST00000393451	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		40.27	■■■■■ 4.04
ST7-208	ENST00000393451	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		40.23	■■■■■ 4.03
ST7-208	ENST00000393451	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		40.2	■■■■■ 4.03
ST7-208	ENST00000393451	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		40.19	■■■■■ 4.02
ST7-208	ENST00000393451	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		40.18	■■■■■ 4.02

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms