Protein–RNA interactions for Protein: P51686

CCR9, C-C chemokine receptor type 9, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR9P51686 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCR9P51686 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCR9P51686 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCR9P51686 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCR9P51686 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCR9P51686 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCR9P51686 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCR9P51686 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCR9P51686 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCR9P51686 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCR9P51686 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCR9P51686 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCR9P51686 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCR9P51686 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCR9P51686 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCR9P51686 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCR9P51686 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCR9P51686 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCR9P51686 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCR9P51686 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCR9P51686 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCR9P51686 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCR9P51686 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCR9P51686 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCR9P51686 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCR9P51686 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCR9P51686 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCR9P51686 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCR9P51686 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCR9P51686 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCR9P51686 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCR9P51686 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCR9P51686 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCR9P51686 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCR9P51686 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCR9P51686 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCR9P51686 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCR9P51686 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCR9P51686 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCR9P51686 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCR9P51686 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCR9P51686 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCR9P51686 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCR9P51686 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCR9P51686 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCR9P51686 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCR9P51686 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCR9P51686 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCR9P51686 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCR9P51686 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCR9P51686 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCR9P51686 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCR9P51686 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCR9P51686 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCR9P51686 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCR9P51686 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCR9P51686 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCR9P51686 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCR9P51686 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCR9P51686 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCR9P51686 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCR9P51686 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCR9P51686 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR9P51686 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR9P51686 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR9P51686 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR9P51686 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR9P51686 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR9P51686 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR9P51686 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCR9P51686 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCR9P51686 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCR9P51686 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCR9P51686 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCR9P51686 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCR9P51686 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCR9P51686 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCR9P51686 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCR9P51686 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCR9P51686 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCR9P51686 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCR9P51686 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCR9P51686 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCR9P51686 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCR9P51686 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR9P51686 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR9P51686 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCR9P51686 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCR9P51686 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCR9P51686 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCR9P51686 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCR9P51686 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCR9P51686 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCR9P51686 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCR9P51686 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCR9P51686 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCR9P51686 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCR9P51686 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCR9P51686 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCR9P51686 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.5 ms