Protein–RNA interactions for Protein: P05114

HMGN1, Non-histone chromosomal protein HMG-14, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN1P05114 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HMGN1P05114 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HMGN1P05114 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HMGN1P05114 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMGN1P05114 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HMGN1P05114 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HMGN1P05114 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HMGN1P05114 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HMGN1P05114 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMGN1P05114 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMGN1P05114 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMGN1P05114 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGN1P05114 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGN1P05114 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGN1P05114 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMGN1P05114 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
HMGN1P05114 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HMGN1P05114 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMGN1P05114 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HMGN1P05114 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMGN1P05114 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMGN1P05114 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGN1P05114 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HMGN1P05114 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HMGN1P05114 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMGN1P05114 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HMGN1P05114 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HMGN1P05114 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMGN1P05114 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMGN1P05114 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMGN1P05114 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HMGN1P05114 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HMGN1P05114 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HMGN1P05114 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMGN1P05114 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGN1P05114 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGN1P05114 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGN1P05114 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGN1P05114 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGN1P05114 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HMGN1P05114 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HMGN1P05114 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HMGN1P05114 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMGN1P05114 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGN1P05114 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMGN1P05114 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMGN1P05114 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMGN1P05114 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMGN1P05114 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMGN1P05114 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGN1P05114 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGN1P05114 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMGN1P05114 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGN1P05114 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGN1P05114 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGN1P05114 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGN1P05114 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMGN1P05114 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMGN1P05114 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGN1P05114 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGN1P05114 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMGN1P05114 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGN1P05114 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGN1P05114 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMGN1P05114 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMGN1P05114 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGN1P05114 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGN1P05114 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGN1P05114 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMGN1P05114 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMGN1P05114 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMGN1P05114 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HMGN1P05114 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMGN1P05114 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMGN1P05114 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMGN1P05114 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMGN1P05114 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGN1P05114 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HMGN1P05114 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HMGN1P05114 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMGN1P05114 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMGN1P05114 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HMGN1P05114 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMGN1P05114 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMGN1P05114 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGN1P05114 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMGN1P05114 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGN1P05114 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGN1P05114 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGN1P05114 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGN1P05114 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGN1P05114 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGN1P05114 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGN1P05114 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGN1P05114 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGN1P05114 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGN1P05114 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGN1P05114 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGN1P05114 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGN1P05114 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 353.9 ms