Protein–RNA interactions for Protein: P05114

HMGN1, Non-histone chromosomal protein HMG-14, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN1P05114 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
HMGN1P05114 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HMGN1P05114 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HMGN1P05114 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HMGN1P05114 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HMGN1P05114 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HMGN1P05114 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
HMGN1P05114 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HMGN1P05114 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HMGN1P05114 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HMGN1P05114 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HMGN1P05114 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HMGN1P05114 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HMGN1P05114 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HMGN1P05114 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HMGN1P05114 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HMGN1P05114 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HMGN1P05114 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HMGN1P05114 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HMGN1P05114 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HMGN1P05114 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HMGN1P05114 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HMGN1P05114 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HMGN1P05114 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HMGN1P05114 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HMGN1P05114 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HMGN1P05114 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HMGN1P05114 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HMGN1P05114 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HMGN1P05114 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HMGN1P05114 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HMGN1P05114 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HMGN1P05114 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HMGN1P05114 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
HMGN1P05114 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HMGN1P05114 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HMGN1P05114 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HMGN1P05114 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HMGN1P05114 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HMGN1P05114 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HMGN1P05114 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HMGN1P05114 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HMGN1P05114 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HMGN1P05114 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HMGN1P05114 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HMGN1P05114 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HMGN1P05114 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HMGN1P05114 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HMGN1P05114 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HMGN1P05114 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HMGN1P05114 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HMGN1P05114 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HMGN1P05114 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HMGN1P05114 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HMGN1P05114 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HMGN1P05114 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HMGN1P05114 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HMGN1P05114 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HMGN1P05114 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HMGN1P05114 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HMGN1P05114 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HMGN1P05114 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HMGN1P05114 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HMGN1P05114 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HMGN1P05114 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMGN1P05114 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HMGN1P05114 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HMGN1P05114 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HMGN1P05114 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HMGN1P05114 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMGN1P05114 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HMGN1P05114 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HMGN1P05114 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMGN1P05114 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HMGN1P05114 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMGN1P05114 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMGN1P05114 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMGN1P05114 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMGN1P05114 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HMGN1P05114 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HMGN1P05114 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMGN1P05114 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HMGN1P05114 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMGN1P05114 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
HMGN1P05114 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HMGN1P05114 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HMGN1P05114 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMGN1P05114 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMGN1P05114 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMGN1P05114 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMGN1P05114 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMGN1P05114 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HMGN1P05114 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HMGN1P05114 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HMGN1P05114 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HMGN1P05114 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HMGN1P05114 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HMGN1P05114 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HMGN1P05114 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HMGN1P05114 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms