Protein–RNA interactions for Protein: P01011

SERPINA3, Alpha-1-antichymotrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA3P01011 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SERPINA3P01011 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SERPINA3P01011 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SERPINA3P01011 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SERPINA3P01011 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SERPINA3P01011 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SERPINA3P01011 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SERPINA3P01011 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SERPINA3P01011 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SERPINA3P01011 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SERPINA3P01011 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SERPINA3P01011 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SERPINA3P01011 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SERPINA3P01011 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SERPINA3P01011 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SERPINA3P01011 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SERPINA3P01011 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SERPINA3P01011 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SERPINA3P01011 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SERPINA3P01011 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SERPINA3P01011 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SERPINA3P01011 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SERPINA3P01011 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SERPINA3P01011 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SERPINA3P01011 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SERPINA3P01011 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SERPINA3P01011 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SERPINA3P01011 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SERPINA3P01011 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SERPINA3P01011 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SERPINA3P01011 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SERPINA3P01011 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SERPINA3P01011 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SERPINA3P01011 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SERPINA3P01011 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SERPINA3P01011 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SERPINA3P01011 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SERPINA3P01011 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SERPINA3P01011 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SERPINA3P01011 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SERPINA3P01011 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SERPINA3P01011 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SERPINA3P01011 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SERPINA3P01011 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SERPINA3P01011 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SERPINA3P01011 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SERPINA3P01011 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SERPINA3P01011 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SERPINA3P01011 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SERPINA3P01011 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SERPINA3P01011 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SERPINA3P01011 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SERPINA3P01011 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SERPINA3P01011 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SERPINA3P01011 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SERPINA3P01011 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SERPINA3P01011 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SERPINA3P01011 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SERPINA3P01011 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SERPINA3P01011 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SERPINA3P01011 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SERPINA3P01011 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SERPINA3P01011 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SERPINA3P01011 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SERPINA3P01011 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SERPINA3P01011 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SERPINA3P01011 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SERPINA3P01011 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SERPINA3P01011 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SERPINA3P01011 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SERPINA3P01011 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SERPINA3P01011 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SERPINA3P01011 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SERPINA3P01011 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SERPINA3P01011 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SERPINA3P01011 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SERPINA3P01011 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SERPINA3P01011 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SERPINA3P01011 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SERPINA3P01011 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SERPINA3P01011 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SERPINA3P01011 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SERPINA3P01011 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SERPINA3P01011 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SERPINA3P01011 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SERPINA3P01011 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SERPINA3P01011 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SERPINA3P01011 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SERPINA3P01011 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SERPINA3P01011 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SERPINA3P01011 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SERPINA3P01011 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SERPINA3P01011 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SERPINA3P01011 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SERPINA3P01011 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SERPINA3P01011 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SERPINA3P01011 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SERPINA3P01011 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SERPINA3P01011 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SERPINA3P01011 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.5 ms