Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC182A6NF36 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC182A6NF36 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC182A6NF36 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC182A6NF36 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC182A6NF36 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC182A6NF36 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC182A6NF36 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC182A6NF36 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC182A6NF36 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC182A6NF36 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC182A6NF36 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC182A6NF36 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC182A6NF36 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC182A6NF36 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC182A6NF36 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC182A6NF36 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC182A6NF36 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC182A6NF36 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC182A6NF36 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC182A6NF36 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC182A6NF36 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC182A6NF36 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC182A6NF36 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC182A6NF36 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC182A6NF36 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC182A6NF36 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC182A6NF36 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC182A6NF36 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC182A6NF36 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC182A6NF36 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC182A6NF36 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC182A6NF36 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC182A6NF36 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC182A6NF36 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC182A6NF36 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC182A6NF36 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC182A6NF36 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC182A6NF36 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC182A6NF36 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC182A6NF36 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC182A6NF36 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC182A6NF36 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC182A6NF36 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC182A6NF36 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC182A6NF36 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC182A6NF36 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC182A6NF36 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC182A6NF36 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC182A6NF36 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC182A6NF36 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC182A6NF36 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC182A6NF36 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC182A6NF36 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC182A6NF36 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC182A6NF36 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC182A6NF36 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC182A6NF36 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC182A6NF36 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC182A6NF36 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC182A6NF36 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC182A6NF36 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC182A6NF36 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC182A6NF36 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC182A6NF36 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC182A6NF36 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC182A6NF36 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC182A6NF36 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC182A6NF36 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC182A6NF36 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC182A6NF36 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC182A6NF36 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC182A6NF36 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC182A6NF36 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC182A6NF36 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC182A6NF36 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC182A6NF36 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC182A6NF36 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC182A6NF36 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC182A6NF36 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC182A6NF36 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC182A6NF36 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC182A6NF36 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC182A6NF36 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC182A6NF36 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC182A6NF36 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC182A6NF36 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC182A6NF36 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC182A6NF36 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC182A6NF36 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC182A6NF36 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC182A6NF36 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC182A6NF36 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC182A6NF36 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC182A6NF36 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC182A6NF36 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC182A6NF36 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC182A6NF36 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC182A6NF36 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC182A6NF36 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms