Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DYNC1LI1Q9Y6G9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DYNC1LI1Q9Y6G9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DYNC1LI1Q9Y6G9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DYNC1LI1Q9Y6G9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DYNC1LI1Q9Y6G9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DYNC1LI1Q9Y6G9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DYNC1LI1Q9Y6G9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DYNC1LI1Q9Y6G9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DYNC1LI1Q9Y6G9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DYNC1LI1Q9Y6G9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DYNC1LI1Q9Y6G9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DYNC1LI1Q9Y6G9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DYNC1LI1Q9Y6G9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DYNC1LI1Q9Y6G9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DYNC1LI1Q9Y6G9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DYNC1LI1Q9Y6G9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
DYNC1LI1Q9Y6G9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DYNC1LI1Q9Y6G9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DYNC1LI1Q9Y6G9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DYNC1LI1Q9Y6G9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DYNC1LI1Q9Y6G9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DYNC1LI1Q9Y6G9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DYNC1LI1Q9Y6G9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DYNC1LI1Q9Y6G9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DYNC1LI1Q9Y6G9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DYNC1LI1Q9Y6G9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
DYNC1LI1Q9Y6G9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DYNC1LI1Q9Y6G9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DYNC1LI1Q9Y6G9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DYNC1LI1Q9Y6G9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DYNC1LI1Q9Y6G9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DYNC1LI1Q9Y6G9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DYNC1LI1Q9Y6G9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DYNC1LI1Q9Y6G9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DYNC1LI1Q9Y6G9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DYNC1LI1Q9Y6G9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DYNC1LI1Q9Y6G9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DYNC1LI1Q9Y6G9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DYNC1LI1Q9Y6G9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DYNC1LI1Q9Y6G9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DYNC1LI1Q9Y6G9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DYNC1LI1Q9Y6G9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DYNC1LI1Q9Y6G9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DYNC1LI1Q9Y6G9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DYNC1LI1Q9Y6G9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DYNC1LI1Q9Y6G9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DYNC1LI1Q9Y6G9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
DYNC1LI1Q9Y6G9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DYNC1LI1Q9Y6G9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
DYNC1LI1Q9Y6G9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DYNC1LI1Q9Y6G9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DYNC1LI1Q9Y6G9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DYNC1LI1Q9Y6G9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DYNC1LI1Q9Y6G9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DYNC1LI1Q9Y6G9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DYNC1LI1Q9Y6G9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DYNC1LI1Q9Y6G9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DYNC1LI1Q9Y6G9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DYNC1LI1Q9Y6G9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DYNC1LI1Q9Y6G9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DYNC1LI1Q9Y6G9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DYNC1LI1Q9Y6G9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DYNC1LI1Q9Y6G9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DYNC1LI1Q9Y6G9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DYNC1LI1Q9Y6G9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DYNC1LI1Q9Y6G9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DYNC1LI1Q9Y6G9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DYNC1LI1Q9Y6G9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DYNC1LI1Q9Y6G9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DYNC1LI1Q9Y6G9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DYNC1LI1Q9Y6G9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DYNC1LI1Q9Y6G9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DYNC1LI1Q9Y6G9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DYNC1LI1Q9Y6G9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DYNC1LI1Q9Y6G9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DYNC1LI1Q9Y6G9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DYNC1LI1Q9Y6G9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DYNC1LI1Q9Y6G9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DYNC1LI1Q9Y6G9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DYNC1LI1Q9Y6G9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DYNC1LI1Q9Y6G9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
DYNC1LI1Q9Y6G9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms