Protein–RNA interactions for Protein: P04196

HRG, Histidine-rich glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRGP04196 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HRGP04196 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HRGP04196 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HRGP04196 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HRGP04196 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HRGP04196 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HRGP04196 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HRGP04196 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HRGP04196 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HRGP04196 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HRGP04196 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HRGP04196 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HRGP04196 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HRGP04196 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HRGP04196 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HRGP04196 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HRGP04196 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HRGP04196 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HRGP04196 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HRGP04196 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HRGP04196 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HRGP04196 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HRGP04196 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HRGP04196 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HRGP04196 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HRGP04196 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HRGP04196 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HRGP04196 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HRGP04196 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HRGP04196 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HRGP04196 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HRGP04196 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HRGP04196 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HRGP04196 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HRGP04196 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HRGP04196 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HRGP04196 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HRGP04196 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HRGP04196 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HRGP04196 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HRGP04196 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HRGP04196 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HRGP04196 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HRGP04196 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HRGP04196 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HRGP04196 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HRGP04196 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HRGP04196 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HRGP04196 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HRGP04196 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HRGP04196 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HRGP04196 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HRGP04196 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HRGP04196 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HRGP04196 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HRGP04196 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HRGP04196 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HRGP04196 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HRGP04196 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HRGP04196 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HRGP04196 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HRGP04196 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HRGP04196 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HRGP04196 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HRGP04196 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HRGP04196 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HRGP04196 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HRGP04196 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HRGP04196 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HRGP04196 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HRGP04196 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HRGP04196 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HRGP04196 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HRGP04196 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HRGP04196 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HRGP04196 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HRGP04196 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HRGP04196 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HRGP04196 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HRGP04196 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HRGP04196 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HRGP04196 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HRGP04196 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HRGP04196 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HRGP04196 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HRGP04196 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HRGP04196 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HRGP04196 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HRGP04196 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HRGP04196 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HRGP04196 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HRGP04196 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HRGP04196 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HRGP04196 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HRGP04196 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HRGP04196 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HRGP04196 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HRGP04196 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HRGP04196 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HRGP04196 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms