Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
COG6Q9Y2V7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
COG6Q9Y2V7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
COG6Q9Y2V7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
COG6Q9Y2V7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
COG6Q9Y2V7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
COG6Q9Y2V7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
COG6Q9Y2V7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
COG6Q9Y2V7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
COG6Q9Y2V7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
COG6Q9Y2V7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
COG6Q9Y2V7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
COG6Q9Y2V7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
COG6Q9Y2V7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
COG6Q9Y2V7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
COG6Q9Y2V7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
COG6Q9Y2V7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
COG6Q9Y2V7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
COG6Q9Y2V7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
COG6Q9Y2V7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
COG6Q9Y2V7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
COG6Q9Y2V7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
COG6Q9Y2V7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
COG6Q9Y2V7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
COG6Q9Y2V7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
COG6Q9Y2V7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
COG6Q9Y2V7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
COG6Q9Y2V7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
COG6Q9Y2V7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
COG6Q9Y2V7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
COG6Q9Y2V7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
COG6Q9Y2V7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
COG6Q9Y2V7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
COG6Q9Y2V7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
COG6Q9Y2V7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
COG6Q9Y2V7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
COG6Q9Y2V7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
COG6Q9Y2V7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.82■■■■□ 3
COG6Q9Y2V7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
COG6Q9Y2V7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
COG6Q9Y2V7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
COG6Q9Y2V7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
COG6Q9Y2V7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
COG6Q9Y2V7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
COG6Q9Y2V7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
COG6Q9Y2V7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
COG6Q9Y2V7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
COG6Q9Y2V7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
COG6Q9Y2V7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
COG6Q9Y2V7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
COG6Q9Y2V7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
COG6Q9Y2V7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
COG6Q9Y2V7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
COG6Q9Y2V7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
COG6Q9Y2V7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
COG6Q9Y2V7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
COG6Q9Y2V7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
COG6Q9Y2V7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
COG6Q9Y2V7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
COG6Q9Y2V7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
COG6Q9Y2V7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
COG6Q9Y2V7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
COG6Q9Y2V7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
COG6Q9Y2V7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
COG6Q9Y2V7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
COG6Q9Y2V7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
COG6Q9Y2V7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
COG6Q9Y2V7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
COG6Q9Y2V7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
COG6Q9Y2V7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
COG6Q9Y2V7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
COG6Q9Y2V7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
COG6Q9Y2V7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
COG6Q9Y2V7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
COG6Q9Y2V7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
COG6Q9Y2V7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
COG6Q9Y2V7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
COG6Q9Y2V7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
COG6Q9Y2V7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
COG6Q9Y2V7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
COG6Q9Y2V7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
COG6Q9Y2V7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
COG6Q9Y2V7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
COG6Q9Y2V7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
COG6Q9Y2V7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
COG6Q9Y2V7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
COG6Q9Y2V7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
COG6Q9Y2V7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
COG6Q9Y2V7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
COG6Q9Y2V7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
COG6Q9Y2V7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
COG6Q9Y2V7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
COG6Q9Y2V7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
COG6Q9Y2V7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
COG6Q9Y2V7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
COG6Q9Y2V7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
COG6Q9Y2V7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
COG6Q9Y2V7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
COG6Q9Y2V7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
COG6Q9Y2V7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms