Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1DQ9Y2S0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1DQ9Y2S0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1DQ9Y2S0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1DQ9Y2S0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1DQ9Y2S0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1DQ9Y2S0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1DQ9Y2S0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1DQ9Y2S0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1DQ9Y2S0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1DQ9Y2S0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1DQ9Y2S0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1DQ9Y2S0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1DQ9Y2S0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1DQ9Y2S0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1DQ9Y2S0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1DQ9Y2S0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1DQ9Y2S0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1DQ9Y2S0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1DQ9Y2S0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1DQ9Y2S0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR1DQ9Y2S0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR1DQ9Y2S0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR1DQ9Y2S0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1DQ9Y2S0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1DQ9Y2S0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1DQ9Y2S0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1DQ9Y2S0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR1DQ9Y2S0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1DQ9Y2S0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1DQ9Y2S0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1DQ9Y2S0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1DQ9Y2S0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1DQ9Y2S0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1DQ9Y2S0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1DQ9Y2S0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1DQ9Y2S0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1DQ9Y2S0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1DQ9Y2S0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1DQ9Y2S0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1DQ9Y2S0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1DQ9Y2S0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1DQ9Y2S0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1DQ9Y2S0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1DQ9Y2S0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1DQ9Y2S0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1DQ9Y2S0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1DQ9Y2S0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1DQ9Y2S0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR1DQ9Y2S0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR1DQ9Y2S0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR1DQ9Y2S0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR1DQ9Y2S0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR1DQ9Y2S0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR1DQ9Y2S0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR1DQ9Y2S0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1DQ9Y2S0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1DQ9Y2S0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1DQ9Y2S0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1DQ9Y2S0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1DQ9Y2S0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1DQ9Y2S0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1DQ9Y2S0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1DQ9Y2S0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1DQ9Y2S0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1DQ9Y2S0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1DQ9Y2S0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1DQ9Y2S0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1DQ9Y2S0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1DQ9Y2S0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1DQ9Y2S0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1DQ9Y2S0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1DQ9Y2S0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1DQ9Y2S0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1DQ9Y2S0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1DQ9Y2S0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1DQ9Y2S0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1DQ9Y2S0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1DQ9Y2S0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR1DQ9Y2S0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1DQ9Y2S0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1DQ9Y2S0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1DQ9Y2S0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR1DQ9Y2S0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1DQ9Y2S0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1DQ9Y2S0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1DQ9Y2S0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1DQ9Y2S0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1DQ9Y2S0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1DQ9Y2S0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1DQ9Y2S0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1DQ9Y2S0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1DQ9Y2S0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1DQ9Y2S0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1DQ9Y2S0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1DQ9Y2S0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1DQ9Y2S0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR1DQ9Y2S0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR1DQ9Y2S0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1DQ9Y2S0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.1 ms