Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASS4Q9NQ75 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CASS4Q9NQ75 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CASS4Q9NQ75 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASS4Q9NQ75 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASS4Q9NQ75 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASS4Q9NQ75 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASS4Q9NQ75 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASS4Q9NQ75 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CASS4Q9NQ75 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASS4Q9NQ75 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASS4Q9NQ75 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASS4Q9NQ75 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASS4Q9NQ75 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASS4Q9NQ75 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASS4Q9NQ75 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASS4Q9NQ75 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CASS4Q9NQ75 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CASS4Q9NQ75 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CASS4Q9NQ75 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CASS4Q9NQ75 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASS4Q9NQ75 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASS4Q9NQ75 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASS4Q9NQ75 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASS4Q9NQ75 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASS4Q9NQ75 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASS4Q9NQ75 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASS4Q9NQ75 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASS4Q9NQ75 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASS4Q9NQ75 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASS4Q9NQ75 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASS4Q9NQ75 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASS4Q9NQ75 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASS4Q9NQ75 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASS4Q9NQ75 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CASS4Q9NQ75 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CASS4Q9NQ75 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CASS4Q9NQ75 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CASS4Q9NQ75 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CASS4Q9NQ75 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CASS4Q9NQ75 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASS4Q9NQ75 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASS4Q9NQ75 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASS4Q9NQ75 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASS4Q9NQ75 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASS4Q9NQ75 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASS4Q9NQ75 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASS4Q9NQ75 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASS4Q9NQ75 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASS4Q9NQ75 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASS4Q9NQ75 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASS4Q9NQ75 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASS4Q9NQ75 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASS4Q9NQ75 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CASS4Q9NQ75 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASS4Q9NQ75 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASS4Q9NQ75 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASS4Q9NQ75 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASS4Q9NQ75 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASS4Q9NQ75 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASS4Q9NQ75 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CASS4Q9NQ75 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASS4Q9NQ75 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CASS4Q9NQ75 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASS4Q9NQ75 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASS4Q9NQ75 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASS4Q9NQ75 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CASS4Q9NQ75 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CASS4Q9NQ75 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASS4Q9NQ75 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASS4Q9NQ75 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASS4Q9NQ75 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASS4Q9NQ75 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASS4Q9NQ75 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CASS4Q9NQ75 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASS4Q9NQ75 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASS4Q9NQ75 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CASS4Q9NQ75 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASS4Q9NQ75 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASS4Q9NQ75 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASS4Q9NQ75 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASS4Q9NQ75 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASS4Q9NQ75 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASS4Q9NQ75 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASS4Q9NQ75 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASS4Q9NQ75 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASS4Q9NQ75 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CASS4Q9NQ75 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASS4Q9NQ75 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASS4Q9NQ75 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASS4Q9NQ75 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASS4Q9NQ75 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASS4Q9NQ75 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASS4Q9NQ75 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASS4Q9NQ75 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASS4Q9NQ75 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASS4Q9NQ75 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASS4Q9NQ75 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASS4Q9NQ75 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASS4Q9NQ75 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms