Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBU1

BARX1, Homeobox protein BarH-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX1Q9HBU1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BARX1Q9HBU1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BARX1Q9HBU1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BARX1Q9HBU1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BARX1Q9HBU1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BARX1Q9HBU1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BARX1Q9HBU1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BARX1Q9HBU1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BARX1Q9HBU1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BARX1Q9HBU1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BARX1Q9HBU1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BARX1Q9HBU1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BARX1Q9HBU1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BARX1Q9HBU1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BARX1Q9HBU1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BARX1Q9HBU1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BARX1Q9HBU1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BARX1Q9HBU1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BARX1Q9HBU1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BARX1Q9HBU1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BARX1Q9HBU1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BARX1Q9HBU1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BARX1Q9HBU1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BARX1Q9HBU1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BARX1Q9HBU1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BARX1Q9HBU1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BARX1Q9HBU1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BARX1Q9HBU1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BARX1Q9HBU1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BARX1Q9HBU1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BARX1Q9HBU1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BARX1Q9HBU1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BARX1Q9HBU1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BARX1Q9HBU1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BARX1Q9HBU1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BARX1Q9HBU1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BARX1Q9HBU1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BARX1Q9HBU1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BARX1Q9HBU1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BARX1Q9HBU1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BARX1Q9HBU1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BARX1Q9HBU1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BARX1Q9HBU1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BARX1Q9HBU1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BARX1Q9HBU1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BARX1Q9HBU1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BARX1Q9HBU1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BARX1Q9HBU1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BARX1Q9HBU1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BARX1Q9HBU1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BARX1Q9HBU1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BARX1Q9HBU1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BARX1Q9HBU1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BARX1Q9HBU1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BARX1Q9HBU1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BARX1Q9HBU1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BARX1Q9HBU1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BARX1Q9HBU1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BARX1Q9HBU1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BARX1Q9HBU1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BARX1Q9HBU1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BARX1Q9HBU1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BARX1Q9HBU1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BARX1Q9HBU1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BARX1Q9HBU1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BARX1Q9HBU1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BARX1Q9HBU1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BARX1Q9HBU1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BARX1Q9HBU1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BARX1Q9HBU1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BARX1Q9HBU1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BARX1Q9HBU1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BARX1Q9HBU1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BARX1Q9HBU1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BARX1Q9HBU1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BARX1Q9HBU1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BARX1Q9HBU1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BARX1Q9HBU1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BARX1Q9HBU1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BARX1Q9HBU1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BARX1Q9HBU1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BARX1Q9HBU1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BARX1Q9HBU1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BARX1Q9HBU1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BARX1Q9HBU1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BARX1Q9HBU1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BARX1Q9HBU1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BARX1Q9HBU1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BARX1Q9HBU1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BARX1Q9HBU1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BARX1Q9HBU1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BARX1Q9HBU1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BARX1Q9HBU1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BARX1Q9HBU1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BARX1Q9HBU1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BARX1Q9HBU1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BARX1Q9HBU1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BARX1Q9HBU1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BARX1Q9HBU1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BARX1Q9HBU1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms