Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PRKRIP1Q9H875 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PRKRIP1Q9H875 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PRKRIP1Q9H875 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PRKRIP1Q9H875 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PRKRIP1Q9H875 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PRKRIP1Q9H875 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PRKRIP1Q9H875 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PRKRIP1Q9H875 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PRKRIP1Q9H875 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
PRKRIP1Q9H875 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PRKRIP1Q9H875 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PRKRIP1Q9H875 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
PRKRIP1Q9H875 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PRKRIP1Q9H875 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PRKRIP1Q9H875 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
PRKRIP1Q9H875 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PRKRIP1Q9H875 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PRKRIP1Q9H875 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PRKRIP1Q9H875 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PRKRIP1Q9H875 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PRKRIP1Q9H875 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PRKRIP1Q9H875 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PRKRIP1Q9H875 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PRKRIP1Q9H875 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PRKRIP1Q9H875 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PRKRIP1Q9H875 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PRKRIP1Q9H875 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PRKRIP1Q9H875 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PRKRIP1Q9H875 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PRKRIP1Q9H875 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PRKRIP1Q9H875 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
PRKRIP1Q9H875 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PRKRIP1Q9H875 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PRKRIP1Q9H875 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PRKRIP1Q9H875 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PRKRIP1Q9H875 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PRKRIP1Q9H875 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PRKRIP1Q9H875 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
PRKRIP1Q9H875 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PRKRIP1Q9H875 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PRKRIP1Q9H875 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
PRKRIP1Q9H875 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PRKRIP1Q9H875 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
PRKRIP1Q9H875 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PRKRIP1Q9H875 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PRKRIP1Q9H875 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PRKRIP1Q9H875 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
PRKRIP1Q9H875 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PRKRIP1Q9H875 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PRKRIP1Q9H875 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PRKRIP1Q9H875 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PRKRIP1Q9H875 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PRKRIP1Q9H875 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PRKRIP1Q9H875 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PRKRIP1Q9H875 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PRKRIP1Q9H875 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
PRKRIP1Q9H875 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PRKRIP1Q9H875 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PRKRIP1Q9H875 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PRKRIP1Q9H875 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PRKRIP1Q9H875 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PRKRIP1Q9H875 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PRKRIP1Q9H875 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PRKRIP1Q9H875 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PRKRIP1Q9H875 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PRKRIP1Q9H875 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PRKRIP1Q9H875 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PRKRIP1Q9H875 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PRKRIP1Q9H875 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PRKRIP1Q9H875 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PRKRIP1Q9H875 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PRKRIP1Q9H875 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PRKRIP1Q9H875 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PRKRIP1Q9H875 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PRKRIP1Q9H875 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PRKRIP1Q9H875 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PRKRIP1Q9H875 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PRKRIP1Q9H875 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PRKRIP1Q9H875 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PRKRIP1Q9H875 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PRKRIP1Q9H875 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PRKRIP1Q9H875 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PRKRIP1Q9H875 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PRKRIP1Q9H875 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PRKRIP1Q9H875 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PRKRIP1Q9H875 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PRKRIP1Q9H875 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PRKRIP1Q9H875 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PRKRIP1Q9H875 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PRKRIP1Q9H875 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
PRKRIP1Q9H875 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PRKRIP1Q9H875 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRKRIP1Q9H875 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRKRIP1Q9H875 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PRKRIP1Q9H875 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PRKRIP1Q9H875 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PRKRIP1Q9H875 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PRKRIP1Q9H875 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PRKRIP1Q9H875 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms