Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HERPUD2Q9BSE4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HERPUD2Q9BSE4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HERPUD2Q9BSE4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HERPUD2Q9BSE4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HERPUD2Q9BSE4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HERPUD2Q9BSE4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
HERPUD2Q9BSE4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HERPUD2Q9BSE4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HERPUD2Q9BSE4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HERPUD2Q9BSE4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HERPUD2Q9BSE4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HERPUD2Q9BSE4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HERPUD2Q9BSE4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HERPUD2Q9BSE4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HERPUD2Q9BSE4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HERPUD2Q9BSE4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HERPUD2Q9BSE4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
HERPUD2Q9BSE4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HERPUD2Q9BSE4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HERPUD2Q9BSE4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HERPUD2Q9BSE4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HERPUD2Q9BSE4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HERPUD2Q9BSE4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HERPUD2Q9BSE4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HERPUD2Q9BSE4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HERPUD2Q9BSE4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HERPUD2Q9BSE4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HERPUD2Q9BSE4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HERPUD2Q9BSE4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HERPUD2Q9BSE4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HERPUD2Q9BSE4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HERPUD2Q9BSE4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HERPUD2Q9BSE4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HERPUD2Q9BSE4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
HERPUD2Q9BSE4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HERPUD2Q9BSE4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HERPUD2Q9BSE4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HERPUD2Q9BSE4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HERPUD2Q9BSE4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HERPUD2Q9BSE4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HERPUD2Q9BSE4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HERPUD2Q9BSE4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HERPUD2Q9BSE4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HERPUD2Q9BSE4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HERPUD2Q9BSE4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HERPUD2Q9BSE4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HERPUD2Q9BSE4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HERPUD2Q9BSE4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HERPUD2Q9BSE4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HERPUD2Q9BSE4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HERPUD2Q9BSE4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HERPUD2Q9BSE4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HERPUD2Q9BSE4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HERPUD2Q9BSE4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HERPUD2Q9BSE4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HERPUD2Q9BSE4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HERPUD2Q9BSE4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HERPUD2Q9BSE4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HERPUD2Q9BSE4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HERPUD2Q9BSE4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HERPUD2Q9BSE4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HERPUD2Q9BSE4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HERPUD2Q9BSE4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HERPUD2Q9BSE4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HERPUD2Q9BSE4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HERPUD2Q9BSE4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HERPUD2Q9BSE4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HERPUD2Q9BSE4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HERPUD2Q9BSE4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HERPUD2Q9BSE4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HERPUD2Q9BSE4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HERPUD2Q9BSE4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HERPUD2Q9BSE4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HERPUD2Q9BSE4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HERPUD2Q9BSE4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HERPUD2Q9BSE4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HERPUD2Q9BSE4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HERPUD2Q9BSE4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HERPUD2Q9BSE4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HERPUD2Q9BSE4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HERPUD2Q9BSE4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HERPUD2Q9BSE4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HERPUD2Q9BSE4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HERPUD2Q9BSE4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HERPUD2Q9BSE4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HERPUD2Q9BSE4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HERPUD2Q9BSE4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HERPUD2Q9BSE4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HERPUD2Q9BSE4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HERPUD2Q9BSE4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HERPUD2Q9BSE4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HERPUD2Q9BSE4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HERPUD2Q9BSE4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HERPUD2Q9BSE4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HERPUD2Q9BSE4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HERPUD2Q9BSE4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HERPUD2Q9BSE4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HERPUD2Q9BSE4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms