Protein–RNA interactions for Protein: Q96A05

ATP6V1E2, V-type proton ATPase subunit E 2, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E2Q96A05 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP6V1E2Q96A05 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP6V1E2Q96A05 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP6V1E2Q96A05 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP6V1E2Q96A05 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP6V1E2Q96A05 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP6V1E2Q96A05 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP6V1E2Q96A05 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP6V1E2Q96A05 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP6V1E2Q96A05 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP6V1E2Q96A05 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP6V1E2Q96A05 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP6V1E2Q96A05 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP6V1E2Q96A05 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP6V1E2Q96A05 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP6V1E2Q96A05 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP6V1E2Q96A05 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP6V1E2Q96A05 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP6V1E2Q96A05 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP6V1E2Q96A05 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP6V1E2Q96A05 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP6V1E2Q96A05 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP6V1E2Q96A05 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP6V1E2Q96A05 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP6V1E2Q96A05 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP6V1E2Q96A05 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP6V1E2Q96A05 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP6V1E2Q96A05 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP6V1E2Q96A05 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP6V1E2Q96A05 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP6V1E2Q96A05 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP6V1E2Q96A05 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP6V1E2Q96A05 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP6V1E2Q96A05 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP6V1E2Q96A05 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP6V1E2Q96A05 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP6V1E2Q96A05 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP6V1E2Q96A05 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP6V1E2Q96A05 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP6V1E2Q96A05 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP6V1E2Q96A05 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP6V1E2Q96A05 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP6V1E2Q96A05 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP6V1E2Q96A05 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP6V1E2Q96A05 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP6V1E2Q96A05 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP6V1E2Q96A05 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP6V1E2Q96A05 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP6V1E2Q96A05 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP6V1E2Q96A05 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP6V1E2Q96A05 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP6V1E2Q96A05 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP6V1E2Q96A05 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP6V1E2Q96A05 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP6V1E2Q96A05 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP6V1E2Q96A05 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP6V1E2Q96A05 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP6V1E2Q96A05 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP6V1E2Q96A05 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP6V1E2Q96A05 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP6V1E2Q96A05 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP6V1E2Q96A05 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP6V1E2Q96A05 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP6V1E2Q96A05 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP6V1E2Q96A05 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP6V1E2Q96A05 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP6V1E2Q96A05 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP6V1E2Q96A05 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP6V1E2Q96A05 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP6V1E2Q96A05 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP6V1E2Q96A05 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP6V1E2Q96A05 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP6V1E2Q96A05 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP6V1E2Q96A05 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP6V1E2Q96A05 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP6V1E2Q96A05 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP6V1E2Q96A05 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP6V1E2Q96A05 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP6V1E2Q96A05 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP6V1E2Q96A05 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP6V1E2Q96A05 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP6V1E2Q96A05 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP6V1E2Q96A05 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP6V1E2Q96A05 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP6V1E2Q96A05 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP6V1E2Q96A05 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP6V1E2Q96A05 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP6V1E2Q96A05 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP6V1E2Q96A05 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP6V1E2Q96A05 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP6V1E2Q96A05 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP6V1E2Q96A05 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP6V1E2Q96A05 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP6V1E2Q96A05 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP6V1E2Q96A05 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP6V1E2Q96A05 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP6V1E2Q96A05 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP6V1E2Q96A05 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP6V1E2Q96A05 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP6V1E2Q96A05 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms