Protein–RNA interactions for Protein: Q86TB3

ALPK2, Alpha-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK2Q86TB3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALPK2Q86TB3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALPK2Q86TB3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALPK2Q86TB3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALPK2Q86TB3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALPK2Q86TB3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ALPK2Q86TB3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ALPK2Q86TB3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALPK2Q86TB3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALPK2Q86TB3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALPK2Q86TB3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALPK2Q86TB3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALPK2Q86TB3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALPK2Q86TB3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALPK2Q86TB3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALPK2Q86TB3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALPK2Q86TB3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALPK2Q86TB3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALPK2Q86TB3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALPK2Q86TB3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALPK2Q86TB3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALPK2Q86TB3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALPK2Q86TB3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALPK2Q86TB3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALPK2Q86TB3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ALPK2Q86TB3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ALPK2Q86TB3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALPK2Q86TB3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALPK2Q86TB3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALPK2Q86TB3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALPK2Q86TB3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALPK2Q86TB3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALPK2Q86TB3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALPK2Q86TB3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ALPK2Q86TB3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ALPK2Q86TB3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALPK2Q86TB3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALPK2Q86TB3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALPK2Q86TB3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALPK2Q86TB3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALPK2Q86TB3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALPK2Q86TB3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALPK2Q86TB3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALPK2Q86TB3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALPK2Q86TB3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ALPK2Q86TB3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALPK2Q86TB3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALPK2Q86TB3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALPK2Q86TB3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ALPK2Q86TB3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALPK2Q86TB3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALPK2Q86TB3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALPK2Q86TB3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALPK2Q86TB3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALPK2Q86TB3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALPK2Q86TB3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALPK2Q86TB3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALPK2Q86TB3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALPK2Q86TB3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALPK2Q86TB3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALPK2Q86TB3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALPK2Q86TB3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALPK2Q86TB3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALPK2Q86TB3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALPK2Q86TB3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ALPK2Q86TB3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALPK2Q86TB3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ALPK2Q86TB3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALPK2Q86TB3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALPK2Q86TB3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALPK2Q86TB3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALPK2Q86TB3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALPK2Q86TB3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALPK2Q86TB3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALPK2Q86TB3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALPK2Q86TB3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALPK2Q86TB3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALPK2Q86TB3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALPK2Q86TB3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALPK2Q86TB3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALPK2Q86TB3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALPK2Q86TB3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALPK2Q86TB3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALPK2Q86TB3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALPK2Q86TB3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALPK2Q86TB3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ALPK2Q86TB3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ALPK2Q86TB3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALPK2Q86TB3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALPK2Q86TB3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALPK2Q86TB3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALPK2Q86TB3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALPK2Q86TB3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALPK2Q86TB3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALPK2Q86TB3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALPK2Q86TB3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALPK2Q86TB3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALPK2Q86TB3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALPK2Q86TB3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALPK2Q86TB3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms