Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TPRNQ4KMQ1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TPRNQ4KMQ1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TPRNQ4KMQ1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TPRNQ4KMQ1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
TPRNQ4KMQ1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TPRNQ4KMQ1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TPRNQ4KMQ1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TPRNQ4KMQ1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TPRNQ4KMQ1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TPRNQ4KMQ1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TPRNQ4KMQ1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TPRNQ4KMQ1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TPRNQ4KMQ1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
TPRNQ4KMQ1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TPRNQ4KMQ1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TPRNQ4KMQ1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TPRNQ4KMQ1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TPRNQ4KMQ1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TPRNQ4KMQ1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TPRNQ4KMQ1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TPRNQ4KMQ1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TPRNQ4KMQ1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TPRNQ4KMQ1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TPRNQ4KMQ1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TPRNQ4KMQ1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TPRNQ4KMQ1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TPRNQ4KMQ1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TPRNQ4KMQ1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TPRNQ4KMQ1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TPRNQ4KMQ1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TPRNQ4KMQ1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TPRNQ4KMQ1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TPRNQ4KMQ1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
TPRNQ4KMQ1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TPRNQ4KMQ1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TPRNQ4KMQ1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TPRNQ4KMQ1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TPRNQ4KMQ1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TPRNQ4KMQ1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TPRNQ4KMQ1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TPRNQ4KMQ1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TPRNQ4KMQ1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TPRNQ4KMQ1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TPRNQ4KMQ1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
TPRNQ4KMQ1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TPRNQ4KMQ1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TPRNQ4KMQ1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TPRNQ4KMQ1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TPRNQ4KMQ1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TPRNQ4KMQ1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TPRNQ4KMQ1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TPRNQ4KMQ1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TPRNQ4KMQ1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TPRNQ4KMQ1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TPRNQ4KMQ1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TPRNQ4KMQ1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TPRNQ4KMQ1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TPRNQ4KMQ1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TPRNQ4KMQ1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TPRNQ4KMQ1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TPRNQ4KMQ1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
TPRNQ4KMQ1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TPRNQ4KMQ1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TPRNQ4KMQ1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TPRNQ4KMQ1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TPRNQ4KMQ1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TPRNQ4KMQ1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TPRNQ4KMQ1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TPRNQ4KMQ1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TPRNQ4KMQ1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TPRNQ4KMQ1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TPRNQ4KMQ1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TPRNQ4KMQ1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TPRNQ4KMQ1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TPRNQ4KMQ1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TPRNQ4KMQ1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TPRNQ4KMQ1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TPRNQ4KMQ1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TPRNQ4KMQ1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
TPRNQ4KMQ1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TPRNQ4KMQ1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
TPRNQ4KMQ1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
TPRNQ4KMQ1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TPRNQ4KMQ1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TPRNQ4KMQ1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TPRNQ4KMQ1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TPRNQ4KMQ1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TPRNQ4KMQ1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
TPRNQ4KMQ1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TPRNQ4KMQ1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TPRNQ4KMQ1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TPRNQ4KMQ1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TPRNQ4KMQ1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TPRNQ4KMQ1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TPRNQ4KMQ1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
TPRNQ4KMQ1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TPRNQ4KMQ1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
TPRNQ4KMQ1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TPRNQ4KMQ1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms