Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
TPRNQ4KMQ1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
TPRNQ4KMQ1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC38.23■■■■□ 3.71
TPRNQ4KMQ1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.05■■■■□ 3.68
TPRNQ4KMQ1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
TPRNQ4KMQ1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
TPRNQ4KMQ1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
TPRNQ4KMQ1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
TPRNQ4KMQ1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
TPRNQ4KMQ1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
TPRNQ4KMQ1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
TPRNQ4KMQ1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
TPRNQ4KMQ1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.65■■■■□ 3.46
TPRNQ4KMQ1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TPRNQ4KMQ1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
TPRNQ4KMQ1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TPRNQ4KMQ1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TPRNQ4KMQ1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TPRNQ4KMQ1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
TPRNQ4KMQ1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TPRNQ4KMQ1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TPRNQ4KMQ1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TPRNQ4KMQ1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TPRNQ4KMQ1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TPRNQ4KMQ1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TPRNQ4KMQ1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TPRNQ4KMQ1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
TPRNQ4KMQ1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TPRNQ4KMQ1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TPRNQ4KMQ1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TPRNQ4KMQ1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
TPRNQ4KMQ1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TPRNQ4KMQ1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TPRNQ4KMQ1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TPRNQ4KMQ1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TPRNQ4KMQ1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TPRNQ4KMQ1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TPRNQ4KMQ1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TPRNQ4KMQ1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TPRNQ4KMQ1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TPRNQ4KMQ1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
TPRNQ4KMQ1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TPRNQ4KMQ1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TPRNQ4KMQ1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TPRNQ4KMQ1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TPRNQ4KMQ1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TPRNQ4KMQ1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TPRNQ4KMQ1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TPRNQ4KMQ1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TPRNQ4KMQ1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TPRNQ4KMQ1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TPRNQ4KMQ1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TPRNQ4KMQ1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TPRNQ4KMQ1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TPRNQ4KMQ1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TPRNQ4KMQ1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TPRNQ4KMQ1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TPRNQ4KMQ1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TPRNQ4KMQ1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TPRNQ4KMQ1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TPRNQ4KMQ1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TPRNQ4KMQ1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TPRNQ4KMQ1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TPRNQ4KMQ1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TPRNQ4KMQ1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TPRNQ4KMQ1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
TPRNQ4KMQ1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
TPRNQ4KMQ1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TPRNQ4KMQ1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TPRNQ4KMQ1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TPRNQ4KMQ1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
TPRNQ4KMQ1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TPRNQ4KMQ1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TPRNQ4KMQ1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TPRNQ4KMQ1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TPRNQ4KMQ1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TPRNQ4KMQ1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TPRNQ4KMQ1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TPRNQ4KMQ1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TPRNQ4KMQ1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TPRNQ4KMQ1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TPRNQ4KMQ1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TPRNQ4KMQ1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TPRNQ4KMQ1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TPRNQ4KMQ1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TPRNQ4KMQ1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TPRNQ4KMQ1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TPRNQ4KMQ1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TPRNQ4KMQ1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TPRNQ4KMQ1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TPRNQ4KMQ1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
TPRNQ4KMQ1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TPRNQ4KMQ1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TPRNQ4KMQ1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TPRNQ4KMQ1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TPRNQ4KMQ1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TPRNQ4KMQ1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TPRNQ4KMQ1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TPRNQ4KMQ1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TPRNQ4KMQ1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
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