Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2H2Q13888 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2H2Q13888 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2H2Q13888 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2H2Q13888 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2H2Q13888 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2H2Q13888 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2H2Q13888 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2H2Q13888 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2H2Q13888 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GTF2H2Q13888 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GTF2H2Q13888 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GTF2H2Q13888 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GTF2H2Q13888 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2H2Q13888 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2H2Q13888 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2H2Q13888 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2H2Q13888 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2H2Q13888 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2H2Q13888 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2H2Q13888 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2H2Q13888 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2H2Q13888 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2H2Q13888 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2H2Q13888 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2H2Q13888 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2H2Q13888 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2H2Q13888 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2H2Q13888 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2H2Q13888 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2H2Q13888 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2H2Q13888 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2H2Q13888 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2H2Q13888 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2H2Q13888 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2H2Q13888 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2H2Q13888 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2H2Q13888 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2H2Q13888 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2H2Q13888 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2H2Q13888 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2H2Q13888 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2H2Q13888 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2H2Q13888 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2H2Q13888 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2H2Q13888 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2H2Q13888 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2H2Q13888 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2H2Q13888 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2H2Q13888 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2H2Q13888 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2H2Q13888 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2H2Q13888 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2H2Q13888 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2H2Q13888 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2H2Q13888 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2H2Q13888 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2H2Q13888 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2H2Q13888 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2H2Q13888 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2H2Q13888 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2H2Q13888 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GTF2H2Q13888 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2H2Q13888 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2H2Q13888 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2H2Q13888 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2H2Q13888 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2H2Q13888 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2H2Q13888 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2H2Q13888 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2H2Q13888 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2H2Q13888 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2H2Q13888 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2H2Q13888 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GTF2H2Q13888 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GTF2H2Q13888 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2H2Q13888 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2H2Q13888 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2H2Q13888 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2H2Q13888 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2H2Q13888 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2H2Q13888 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2H2Q13888 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2H2Q13888 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2H2Q13888 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2H2Q13888 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2H2Q13888 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2H2Q13888 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2H2Q13888 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2H2Q13888 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2H2Q13888 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2H2Q13888 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
GTF2H2Q13888 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2H2Q13888 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2H2Q13888 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2H2Q13888 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2H2Q13888 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2H2Q13888 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2H2Q13888 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2H2Q13888 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
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