Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
XRCC4Q13426 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XRCC4Q13426 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
XRCC4Q13426 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
XRCC4Q13426 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
XRCC4Q13426 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
XRCC4Q13426 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.53■■■□□ 2
XRCC4Q13426 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
XRCC4Q13426 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
XRCC4Q13426 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
XRCC4Q13426 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
XRCC4Q13426 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
XRCC4Q13426 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
XRCC4Q13426 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
XRCC4Q13426 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
XRCC4Q13426 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
XRCC4Q13426 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
XRCC4Q13426 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
XRCC4Q13426 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
XRCC4Q13426 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
XRCC4Q13426 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
XRCC4Q13426 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
XRCC4Q13426 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
XRCC4Q13426 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
XRCC4Q13426 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
XRCC4Q13426 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
XRCC4Q13426 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XRCC4Q13426 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
XRCC4Q13426 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XRCC4Q13426 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
XRCC4Q13426 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
XRCC4Q13426 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
XRCC4Q13426 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XRCC4Q13426 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
XRCC4Q13426 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
XRCC4Q13426 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
XRCC4Q13426 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XRCC4Q13426 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XRCC4Q13426 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
XRCC4Q13426 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
XRCC4Q13426 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XRCC4Q13426 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XRCC4Q13426 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
XRCC4Q13426 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
XRCC4Q13426 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
XRCC4Q13426 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
XRCC4Q13426 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
XRCC4Q13426 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
XRCC4Q13426 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
XRCC4Q13426 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XRCC4Q13426 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
XRCC4Q13426 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
XRCC4Q13426 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
XRCC4Q13426 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
XRCC4Q13426 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
XRCC4Q13426 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
XRCC4Q13426 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
XRCC4Q13426 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
XRCC4Q13426 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
XRCC4Q13426 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
XRCC4Q13426 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
XRCC4Q13426 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
XRCC4Q13426 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
XRCC4Q13426 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
XRCC4Q13426 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
XRCC4Q13426 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
XRCC4Q13426 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
XRCC4Q13426 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
XRCC4Q13426 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
XRCC4Q13426 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
XRCC4Q13426 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
XRCC4Q13426 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
XRCC4Q13426 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
XRCC4Q13426 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
XRCC4Q13426 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
XRCC4Q13426 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
XRCC4Q13426 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
XRCC4Q13426 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XRCC4Q13426 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XRCC4Q13426 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
XRCC4Q13426 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XRCC4Q13426 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
XRCC4Q13426 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
XRCC4Q13426 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
XRCC4Q13426 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
XRCC4Q13426 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
XRCC4Q13426 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
XRCC4Q13426 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
XRCC4Q13426 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
XRCC4Q13426 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
XRCC4Q13426 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
XRCC4Q13426 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
XRCC4Q13426 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
XRCC4Q13426 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
XRCC4Q13426 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
XRCC4Q13426 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
XRCC4Q13426 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
XRCC4Q13426 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
XRCC4Q13426 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
XRCC4Q13426 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
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