Protein–RNA interactions for Protein: Q01851

POU4F1, POU domain, class 4, transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU4F1Q01851 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POU4F1Q01851 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POU4F1Q01851 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POU4F1Q01851 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POU4F1Q01851 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POU4F1Q01851 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POU4F1Q01851 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POU4F1Q01851 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POU4F1Q01851 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
POU4F1Q01851 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POU4F1Q01851 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
POU4F1Q01851 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POU4F1Q01851 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POU4F1Q01851 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POU4F1Q01851 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POU4F1Q01851 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POU4F1Q01851 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POU4F1Q01851 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POU4F1Q01851 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POU4F1Q01851 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POU4F1Q01851 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POU4F1Q01851 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POU4F1Q01851 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POU4F1Q01851 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POU4F1Q01851 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POU4F1Q01851 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POU4F1Q01851 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POU4F1Q01851 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POU4F1Q01851 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POU4F1Q01851 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POU4F1Q01851 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
POU4F1Q01851 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POU4F1Q01851 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POU4F1Q01851 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POU4F1Q01851 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POU4F1Q01851 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POU4F1Q01851 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POU4F1Q01851 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
POU4F1Q01851 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
POU4F1Q01851 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POU4F1Q01851 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
POU4F1Q01851 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
POU4F1Q01851 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POU4F1Q01851 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POU4F1Q01851 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POU4F1Q01851 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POU4F1Q01851 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POU4F1Q01851 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POU4F1Q01851 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POU4F1Q01851 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POU4F1Q01851 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
POU4F1Q01851 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POU4F1Q01851 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POU4F1Q01851 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POU4F1Q01851 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POU4F1Q01851 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POU4F1Q01851 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POU4F1Q01851 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POU4F1Q01851 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POU4F1Q01851 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POU4F1Q01851 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POU4F1Q01851 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
POU4F1Q01851 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POU4F1Q01851 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POU4F1Q01851 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POU4F1Q01851 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POU4F1Q01851 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POU4F1Q01851 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POU4F1Q01851 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POU4F1Q01851 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
POU4F1Q01851 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POU4F1Q01851 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POU4F1Q01851 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POU4F1Q01851 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POU4F1Q01851 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POU4F1Q01851 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POU4F1Q01851 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POU4F1Q01851 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POU4F1Q01851 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POU4F1Q01851 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POU4F1Q01851 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POU4F1Q01851 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POU4F1Q01851 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POU4F1Q01851 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POU4F1Q01851 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POU4F1Q01851 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POU4F1Q01851 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POU4F1Q01851 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POU4F1Q01851 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POU4F1Q01851 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POU4F1Q01851 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POU4F1Q01851 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POU4F1Q01851 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POU4F1Q01851 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POU4F1Q01851 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POU4F1Q01851 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POU4F1Q01851 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POU4F1Q01851 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
POU4F1Q01851 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POU4F1Q01851 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms