Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPZ1P61923 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
COPZ1P61923 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPZ1P61923 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPZ1P61923 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPZ1P61923 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPZ1P61923 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPZ1P61923 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPZ1P61923 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPZ1P61923 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPZ1P61923 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
COPZ1P61923 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPZ1P61923 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPZ1P61923 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPZ1P61923 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPZ1P61923 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPZ1P61923 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPZ1P61923 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPZ1P61923 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPZ1P61923 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPZ1P61923 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPZ1P61923 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPZ1P61923 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPZ1P61923 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPZ1P61923 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPZ1P61923 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPZ1P61923 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COPZ1P61923 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPZ1P61923 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPZ1P61923 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPZ1P61923 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPZ1P61923 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPZ1P61923 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPZ1P61923 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPZ1P61923 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPZ1P61923 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPZ1P61923 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPZ1P61923 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPZ1P61923 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPZ1P61923 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COPZ1P61923 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COPZ1P61923 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COPZ1P61923 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COPZ1P61923 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COPZ1P61923 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COPZ1P61923 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COPZ1P61923 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPZ1P61923 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPZ1P61923 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPZ1P61923 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPZ1P61923 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPZ1P61923 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPZ1P61923 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPZ1P61923 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPZ1P61923 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPZ1P61923 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPZ1P61923 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPZ1P61923 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPZ1P61923 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPZ1P61923 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPZ1P61923 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPZ1P61923 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPZ1P61923 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPZ1P61923 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPZ1P61923 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPZ1P61923 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPZ1P61923 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPZ1P61923 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPZ1P61923 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
COPZ1P61923 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPZ1P61923 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPZ1P61923 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPZ1P61923 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPZ1P61923 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPZ1P61923 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPZ1P61923 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPZ1P61923 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPZ1P61923 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPZ1P61923 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPZ1P61923 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COPZ1P61923 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPZ1P61923 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COPZ1P61923 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPZ1P61923 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPZ1P61923 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPZ1P61923 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPZ1P61923 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPZ1P61923 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPZ1P61923 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPZ1P61923 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
COPZ1P61923 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPZ1P61923 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPZ1P61923 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COPZ1P61923 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPZ1P61923 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPZ1P61923 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPZ1P61923 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPZ1P61923 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPZ1P61923 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPZ1P61923 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms