Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
COPZ1P61923 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
COPZ1P61923 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
COPZ1P61923 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
COPZ1P61923 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
COPZ1P61923 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
COPZ1P61923 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
COPZ1P61923 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
COPZ1P61923 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
COPZ1P61923 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
COPZ1P61923 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
COPZ1P61923 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
COPZ1P61923 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
COPZ1P61923 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
COPZ1P61923 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
COPZ1P61923 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
COPZ1P61923 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COPZ1P61923 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COPZ1P61923 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
COPZ1P61923 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COPZ1P61923 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
COPZ1P61923 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
COPZ1P61923 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
COPZ1P61923 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COPZ1P61923 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COPZ1P61923 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COPZ1P61923 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COPZ1P61923 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COPZ1P61923 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COPZ1P61923 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COPZ1P61923 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
COPZ1P61923 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COPZ1P61923 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COPZ1P61923 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COPZ1P61923 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COPZ1P61923 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COPZ1P61923 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COPZ1P61923 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COPZ1P61923 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COPZ1P61923 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
COPZ1P61923 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COPZ1P61923 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COPZ1P61923 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COPZ1P61923 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COPZ1P61923 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COPZ1P61923 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
COPZ1P61923 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COPZ1P61923 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COPZ1P61923 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COPZ1P61923 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COPZ1P61923 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COPZ1P61923 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COPZ1P61923 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COPZ1P61923 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COPZ1P61923 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COPZ1P61923 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COPZ1P61923 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COPZ1P61923 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COPZ1P61923 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COPZ1P61923 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COPZ1P61923 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COPZ1P61923 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COPZ1P61923 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COPZ1P61923 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COPZ1P61923 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COPZ1P61923 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COPZ1P61923 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COPZ1P61923 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COPZ1P61923 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COPZ1P61923 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COPZ1P61923 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COPZ1P61923 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COPZ1P61923 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COPZ1P61923 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
COPZ1P61923 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COPZ1P61923 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COPZ1P61923 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COPZ1P61923 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
COPZ1P61923 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COPZ1P61923 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COPZ1P61923 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
COPZ1P61923 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COPZ1P61923 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COPZ1P61923 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COPZ1P61923 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COPZ1P61923 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COPZ1P61923 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COPZ1P61923 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COPZ1P61923 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COPZ1P61923 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COPZ1P61923 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COPZ1P61923 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
COPZ1P61923 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COPZ1P61923 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COPZ1P61923 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
COPZ1P61923 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COPZ1P61923 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COPZ1P61923 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COPZ1P61923 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COPZ1P61923 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms