Protein–RNA interactions for Protein: P46092

CCR10, C-C chemokine receptor type 10, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR10P46092 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCR10P46092 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCR10P46092 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCR10P46092 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCR10P46092 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCR10P46092 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCR10P46092 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCR10P46092 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCR10P46092 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCR10P46092 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCR10P46092 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCR10P46092 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCR10P46092 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCR10P46092 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCR10P46092 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCR10P46092 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCR10P46092 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCR10P46092 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCR10P46092 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCR10P46092 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCR10P46092 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCR10P46092 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCR10P46092 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCR10P46092 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCR10P46092 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCR10P46092 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCR10P46092 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCR10P46092 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCR10P46092 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCR10P46092 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCR10P46092 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCR10P46092 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCR10P46092 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCR10P46092 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCR10P46092 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CCR10P46092 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCR10P46092 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCR10P46092 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCR10P46092 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCR10P46092 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCR10P46092 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCR10P46092 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCR10P46092 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCR10P46092 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCR10P46092 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCR10P46092 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCR10P46092 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCR10P46092 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCR10P46092 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCR10P46092 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCR10P46092 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCR10P46092 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCR10P46092 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCR10P46092 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCR10P46092 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCR10P46092 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCR10P46092 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCR10P46092 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCR10P46092 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCR10P46092 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCR10P46092 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCR10P46092 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCR10P46092 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCR10P46092 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCR10P46092 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCR10P46092 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCR10P46092 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCR10P46092 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCR10P46092 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCR10P46092 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCR10P46092 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCR10P46092 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCR10P46092 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCR10P46092 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCR10P46092 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCR10P46092 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCR10P46092 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCR10P46092 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCR10P46092 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCR10P46092 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCR10P46092 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCR10P46092 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCR10P46092 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCR10P46092 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCR10P46092 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCR10P46092 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCR10P46092 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCR10P46092 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCR10P46092 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCR10P46092 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCR10P46092 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCR10P46092 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCR10P46092 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCR10P46092 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCR10P46092 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCR10P46092 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCR10P46092 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCR10P46092 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCR10P46092 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCR10P46092 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms