Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP1P28562 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP1P28562 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP1P28562 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DUSP1P28562 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP1P28562 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP1P28562 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP1P28562 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP1P28562 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP1P28562 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP1P28562 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP1P28562 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP1P28562 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP1P28562 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP1P28562 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP1P28562 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP1P28562 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP1P28562 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUSP1P28562 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP1P28562 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP1P28562 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP1P28562 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP1P28562 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUSP1P28562 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP1P28562 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP1P28562 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUSP1P28562 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP1P28562 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DUSP1P28562 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP1P28562 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUSP1P28562 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP1P28562 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP1P28562 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUSP1P28562 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP1P28562 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP1P28562 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUSP1P28562 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP1P28562 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP1P28562 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP1P28562 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP1P28562 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP1P28562 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUSP1P28562 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP1P28562 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP1P28562 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP1P28562 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP1P28562 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DUSP1P28562 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUSP1P28562 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP1P28562 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP1P28562 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP1P28562 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP1P28562 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP1P28562 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP1P28562 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP1P28562 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP1P28562 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP1P28562 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP1P28562 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP1P28562 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP1P28562 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP1P28562 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUSP1P28562 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP1P28562 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP1P28562 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP1P28562 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP1P28562 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP1P28562 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP1P28562 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP1P28562 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP1P28562 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP1P28562 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP1P28562 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP1P28562 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP1P28562 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP1P28562 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP1P28562 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP1P28562 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP1P28562 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP1P28562 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUSP1P28562 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP1P28562 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DUSP1P28562 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP1P28562 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP1P28562 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP1P28562 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUSP1P28562 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP1P28562 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP1P28562 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DUSP1P28562 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP1P28562 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP1P28562 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP1P28562 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DUSP1P28562 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP1P28562 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP1P28562 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DUSP1P28562 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP1P28562 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP1P28562 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DUSP1P28562 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms