Protein–RNA interactions for Protein: P26572

MGAT1, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT1P26572 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MGAT1P26572 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MGAT1P26572 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MGAT1P26572 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MGAT1P26572 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MGAT1P26572 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MGAT1P26572 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MGAT1P26572 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MGAT1P26572 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MGAT1P26572 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MGAT1P26572 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
MGAT1P26572 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MGAT1P26572 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MGAT1P26572 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MGAT1P26572 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MGAT1P26572 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MGAT1P26572 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MGAT1P26572 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MGAT1P26572 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MGAT1P26572 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MGAT1P26572 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MGAT1P26572 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MGAT1P26572 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MGAT1P26572 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MGAT1P26572 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MGAT1P26572 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MGAT1P26572 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MGAT1P26572 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MGAT1P26572 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MGAT1P26572 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MGAT1P26572 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MGAT1P26572 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MGAT1P26572 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MGAT1P26572 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MGAT1P26572 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MGAT1P26572 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MGAT1P26572 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MGAT1P26572 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MGAT1P26572 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MGAT1P26572 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MGAT1P26572 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MGAT1P26572 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MGAT1P26572 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MGAT1P26572 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MGAT1P26572 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MGAT1P26572 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MGAT1P26572 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MGAT1P26572 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MGAT1P26572 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MGAT1P26572 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MGAT1P26572 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MGAT1P26572 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MGAT1P26572 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MGAT1P26572 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MGAT1P26572 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MGAT1P26572 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MGAT1P26572 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MGAT1P26572 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MGAT1P26572 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MGAT1P26572 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MGAT1P26572 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MGAT1P26572 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MGAT1P26572 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MGAT1P26572 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MGAT1P26572 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MGAT1P26572 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MGAT1P26572 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MGAT1P26572 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MGAT1P26572 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MGAT1P26572 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MGAT1P26572 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MGAT1P26572 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MGAT1P26572 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MGAT1P26572 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MGAT1P26572 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MGAT1P26572 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MGAT1P26572 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MGAT1P26572 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MGAT1P26572 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MGAT1P26572 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MGAT1P26572 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MGAT1P26572 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MGAT1P26572 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MGAT1P26572 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MGAT1P26572 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MGAT1P26572 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MGAT1P26572 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MGAT1P26572 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MGAT1P26572 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MGAT1P26572 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MGAT1P26572 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MGAT1P26572 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MGAT1P26572 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MGAT1P26572 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MGAT1P26572 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MGAT1P26572 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
MGAT1P26572 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MGAT1P26572 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MGAT1P26572 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
MGAT1P26572 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms