Protein–RNA interactions for Protein: P01571

IFNA17, Interferon alpha-17, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA17P01571 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFNA17P01571 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFNA17P01571 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFNA17P01571 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFNA17P01571 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFNA17P01571 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNA17P01571 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNA17P01571 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNA17P01571 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNA17P01571 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNA17P01571 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNA17P01571 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IFNA17P01571 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IFNA17P01571 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNA17P01571 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNA17P01571 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNA17P01571 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNA17P01571 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNA17P01571 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNA17P01571 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNA17P01571 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNA17P01571 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNA17P01571 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNA17P01571 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNA17P01571 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNA17P01571 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNA17P01571 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNA17P01571 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNA17P01571 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNA17P01571 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNA17P01571 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNA17P01571 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNA17P01571 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IFNA17P01571 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNA17P01571 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNA17P01571 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNA17P01571 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNA17P01571 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNA17P01571 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNA17P01571 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNA17P01571 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNA17P01571 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNA17P01571 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNA17P01571 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNA17P01571 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNA17P01571 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNA17P01571 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNA17P01571 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNA17P01571 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNA17P01571 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNA17P01571 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNA17P01571 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNA17P01571 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNA17P01571 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNA17P01571 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNA17P01571 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNA17P01571 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNA17P01571 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNA17P01571 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFNA17P01571 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNA17P01571 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNA17P01571 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNA17P01571 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNA17P01571 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNA17P01571 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNA17P01571 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNA17P01571 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNA17P01571 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNA17P01571 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNA17P01571 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNA17P01571 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNA17P01571 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNA17P01571 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNA17P01571 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNA17P01571 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNA17P01571 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNA17P01571 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
IFNA17P01571 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNA17P01571 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNA17P01571 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNA17P01571 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNA17P01571 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNA17P01571 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNA17P01571 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNA17P01571 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNA17P01571 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNA17P01571 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNA17P01571 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNA17P01571 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNA17P01571 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNA17P01571 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFNA17P01571 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFNA17P01571 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IFNA17P01571 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IFNA17P01571 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNA17P01571 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNA17P01571 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNA17P01571 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNA17P01571 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNA17P01571 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms