Protein–RNA interactions for Protein: P01571

IFNA17, Interferon alpha-17, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA17P01571 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IFNA17P01571 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFNA17P01571 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFNA17P01571 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFNA17P01571 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFNA17P01571 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFNA17P01571 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFNA17P01571 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
IFNA17P01571 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFNA17P01571 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFNA17P01571 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFNA17P01571 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFNA17P01571 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFNA17P01571 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFNA17P01571 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFNA17P01571 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFNA17P01571 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFNA17P01571 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IFNA17P01571 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFNA17P01571 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFNA17P01571 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFNA17P01571 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFNA17P01571 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFNA17P01571 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFNA17P01571 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFNA17P01571 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFNA17P01571 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFNA17P01571 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFNA17P01571 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFNA17P01571 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFNA17P01571 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFNA17P01571 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFNA17P01571 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFNA17P01571 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFNA17P01571 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFNA17P01571 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFNA17P01571 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNA17P01571 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFNA17P01571 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFNA17P01571 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFNA17P01571 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFNA17P01571 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFNA17P01571 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNA17P01571 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNA17P01571 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNA17P01571 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFNA17P01571 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFNA17P01571 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFNA17P01571 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFNA17P01571 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFNA17P01571 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNA17P01571 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFNA17P01571 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFNA17P01571 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFNA17P01571 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFNA17P01571 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IFNA17P01571 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNA17P01571 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNA17P01571 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNA17P01571 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNA17P01571 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNA17P01571 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFNA17P01571 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFNA17P01571 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFNA17P01571 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFNA17P01571 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFNA17P01571 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFNA17P01571 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFNA17P01571 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFNA17P01571 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFNA17P01571 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFNA17P01571 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFNA17P01571 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFNA17P01571 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFNA17P01571 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFNA17P01571 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFNA17P01571 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFNA17P01571 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFNA17P01571 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFNA17P01571 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFNA17P01571 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFNA17P01571 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFNA17P01571 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFNA17P01571 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFNA17P01571 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNA17P01571 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNA17P01571 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFNA17P01571 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFNA17P01571 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNA17P01571 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNA17P01571 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFNA17P01571 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNA17P01571 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNA17P01571 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNA17P01571 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNA17P01571 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNA17P01571 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNA17P01571 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNA17P01571 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNA17P01571 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms