Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C6orf47O95873 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C6orf47O95873 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C6orf47O95873 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C6orf47O95873 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C6orf47O95873 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C6orf47O95873 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C6orf47O95873 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C6orf47O95873 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
C6orf47O95873 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C6orf47O95873 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
C6orf47O95873 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C6orf47O95873 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C6orf47O95873 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
C6orf47O95873 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C6orf47O95873 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C6orf47O95873 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C6orf47O95873 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C6orf47O95873 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C6orf47O95873 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C6orf47O95873 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C6orf47O95873 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C6orf47O95873 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C6orf47O95873 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C6orf47O95873 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C6orf47O95873 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C6orf47O95873 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C6orf47O95873 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C6orf47O95873 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C6orf47O95873 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
C6orf47O95873 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C6orf47O95873 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C6orf47O95873 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C6orf47O95873 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C6orf47O95873 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C6orf47O95873 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C6orf47O95873 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C6orf47O95873 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C6orf47O95873 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C6orf47O95873 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C6orf47O95873 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C6orf47O95873 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C6orf47O95873 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C6orf47O95873 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C6orf47O95873 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C6orf47O95873 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
C6orf47O95873 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C6orf47O95873 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C6orf47O95873 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C6orf47O95873 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C6orf47O95873 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C6orf47O95873 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C6orf47O95873 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C6orf47O95873 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C6orf47O95873 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C6orf47O95873 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C6orf47O95873 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C6orf47O95873 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C6orf47O95873 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C6orf47O95873 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C6orf47O95873 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C6orf47O95873 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C6orf47O95873 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C6orf47O95873 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C6orf47O95873 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C6orf47O95873 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C6orf47O95873 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C6orf47O95873 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C6orf47O95873 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C6orf47O95873 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C6orf47O95873 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C6orf47O95873 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C6orf47O95873 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C6orf47O95873 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C6orf47O95873 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C6orf47O95873 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C6orf47O95873 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C6orf47O95873 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C6orf47O95873 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C6orf47O95873 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C6orf47O95873 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C6orf47O95873 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C6orf47O95873 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C6orf47O95873 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C6orf47O95873 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C6orf47O95873 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C6orf47O95873 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C6orf47O95873 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C6orf47O95873 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C6orf47O95873 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C6orf47O95873 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C6orf47O95873 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
C6orf47O95873 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C6orf47O95873 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C6orf47O95873 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
C6orf47O95873 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
C6orf47O95873 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C6orf47O95873 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C6orf47O95873 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C6orf47O95873 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms