Protein–RNA interactions for Protein: O43745

CHP2, Calcineurin B homologous protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP2O43745 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHP2O43745 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHP2O43745 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHP2O43745 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHP2O43745 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHP2O43745 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHP2O43745 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHP2O43745 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHP2O43745 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHP2O43745 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CHP2O43745 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHP2O43745 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHP2O43745 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHP2O43745 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHP2O43745 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHP2O43745 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHP2O43745 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHP2O43745 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHP2O43745 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHP2O43745 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHP2O43745 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHP2O43745 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHP2O43745 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHP2O43745 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHP2O43745 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHP2O43745 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHP2O43745 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHP2O43745 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHP2O43745 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHP2O43745 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHP2O43745 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHP2O43745 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHP2O43745 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHP2O43745 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHP2O43745 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHP2O43745 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHP2O43745 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHP2O43745 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHP2O43745 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHP2O43745 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHP2O43745 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHP2O43745 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHP2O43745 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHP2O43745 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHP2O43745 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHP2O43745 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHP2O43745 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHP2O43745 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHP2O43745 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHP2O43745 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHP2O43745 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHP2O43745 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHP2O43745 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHP2O43745 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHP2O43745 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHP2O43745 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHP2O43745 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHP2O43745 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHP2O43745 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHP2O43745 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHP2O43745 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHP2O43745 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHP2O43745 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHP2O43745 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHP2O43745 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHP2O43745 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHP2O43745 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHP2O43745 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHP2O43745 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHP2O43745 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHP2O43745 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHP2O43745 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHP2O43745 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHP2O43745 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHP2O43745 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHP2O43745 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHP2O43745 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHP2O43745 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHP2O43745 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHP2O43745 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHP2O43745 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHP2O43745 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHP2O43745 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHP2O43745 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHP2O43745 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHP2O43745 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHP2O43745 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHP2O43745 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHP2O43745 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHP2O43745 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHP2O43745 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHP2O43745 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHP2O43745 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHP2O43745 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHP2O43745 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHP2O43745 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHP2O43745 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHP2O43745 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHP2O43745 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHP2O43745 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms