Protein–RNA interactions for Protein: O14543

SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS3O14543 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOCS3O14543 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOCS3O14543 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOCS3O14543 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOCS3O14543 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOCS3O14543 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOCS3O14543 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOCS3O14543 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOCS3O14543 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOCS3O14543 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOCS3O14543 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SOCS3O14543 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOCS3O14543 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOCS3O14543 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOCS3O14543 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOCS3O14543 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOCS3O14543 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOCS3O14543 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOCS3O14543 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SOCS3O14543 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SOCS3O14543 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SOCS3O14543 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOCS3O14543 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOCS3O14543 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOCS3O14543 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOCS3O14543 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SOCS3O14543 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SOCS3O14543 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SOCS3O14543 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SOCS3O14543 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOCS3O14543 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOCS3O14543 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SOCS3O14543 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SOCS3O14543 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SOCS3O14543 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SOCS3O14543 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOCS3O14543 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOCS3O14543 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOCS3O14543 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOCS3O14543 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOCS3O14543 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOCS3O14543 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOCS3O14543 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOCS3O14543 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOCS3O14543 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOCS3O14543 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOCS3O14543 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOCS3O14543 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOCS3O14543 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOCS3O14543 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOCS3O14543 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOCS3O14543 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOCS3O14543 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SOCS3O14543 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SOCS3O14543 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SOCS3O14543 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SOCS3O14543 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SOCS3O14543 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SOCS3O14543 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SOCS3O14543 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOCS3O14543 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOCS3O14543 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOCS3O14543 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SOCS3O14543 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOCS3O14543 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOCS3O14543 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SOCS3O14543 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOCS3O14543 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOCS3O14543 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SOCS3O14543 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOCS3O14543 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOCS3O14543 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOCS3O14543 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOCS3O14543 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOCS3O14543 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOCS3O14543 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOCS3O14543 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOCS3O14543 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SOCS3O14543 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOCS3O14543 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOCS3O14543 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOCS3O14543 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOCS3O14543 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOCS3O14543 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOCS3O14543 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOCS3O14543 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOCS3O14543 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOCS3O14543 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SOCS3O14543 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOCS3O14543 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOCS3O14543 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOCS3O14543 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOCS3O14543 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOCS3O14543 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOCS3O14543 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SOCS3O14543 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOCS3O14543 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOCS3O14543 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOCS3O14543 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SOCS3O14543 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms